Protein–RNA interactions for Protein: P06753

TPM3, Tropomyosin alpha-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3P06753 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TPM3P06753 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
TPM3P06753 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
TPM3P06753 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
TPM3P06753 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TPM3P06753 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TPM3P06753 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TPM3P06753 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
TPM3P06753 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TPM3P06753 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
TPM3P06753 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TPM3P06753 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TPM3P06753 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TPM3P06753 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
TPM3P06753 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TPM3P06753 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
TPM3P06753 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
TPM3P06753 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TPM3P06753 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TPM3P06753 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TPM3P06753 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TPM3P06753 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TPM3P06753 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TPM3P06753 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TPM3P06753 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TPM3P06753 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
TPM3P06753 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TPM3P06753 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TPM3P06753 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TPM3P06753 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TPM3P06753 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TPM3P06753 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TPM3P06753 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TPM3P06753 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TPM3P06753 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TPM3P06753 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TPM3P06753 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TPM3P06753 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TPM3P06753 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TPM3P06753 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TPM3P06753 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TPM3P06753 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TPM3P06753 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TPM3P06753 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TPM3P06753 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TPM3P06753 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TPM3P06753 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TPM3P06753 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TPM3P06753 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TPM3P06753 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TPM3P06753 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TPM3P06753 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.92
TPM3P06753 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TPM3P06753 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TPM3P06753 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TPM3P06753 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TPM3P06753 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TPM3P06753 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TPM3P06753 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TPM3P06753 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TPM3P06753 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TPM3P06753 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TPM3P06753 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TPM3P06753 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TPM3P06753 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TPM3P06753 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TPM3P06753 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TPM3P06753 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TPM3P06753 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TPM3P06753 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TPM3P06753 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TPM3P06753 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TPM3P06753 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TPM3P06753 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TPM3P06753 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TPM3P06753 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TPM3P06753 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TPM3P06753 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TPM3P06753 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TPM3P06753 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TPM3P06753 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TPM3P06753 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TPM3P06753 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TPM3P06753 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TPM3P06753 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TPM3P06753 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TPM3P06753 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TPM3P06753 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TPM3P06753 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TPM3P06753 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TPM3P06753 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TPM3P06753 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TPM3P06753 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
TPM3P06753 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TPM3P06753 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TPM3P06753 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TPM3P06753 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TPM3P06753 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TPM3P06753 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TPM3P06753 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms