Protein–RNA interactions for Protein: P02724

GYPA, Glycophorin-A, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYPAP02724 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GYPAP02724 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GYPAP02724 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GYPAP02724 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GYPAP02724 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GYPAP02724 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GYPAP02724 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GYPAP02724 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GYPAP02724 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GYPAP02724 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GYPAP02724 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GYPAP02724 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GYPAP02724 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GYPAP02724 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GYPAP02724 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GYPAP02724 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GYPAP02724 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GYPAP02724 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GYPAP02724 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GYPAP02724 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GYPAP02724 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GYPAP02724 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GYPAP02724 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GYPAP02724 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GYPAP02724 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GYPAP02724 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GYPAP02724 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GYPAP02724 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GYPAP02724 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GYPAP02724 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GYPAP02724 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GYPAP02724 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GYPAP02724 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GYPAP02724 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GYPAP02724 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GYPAP02724 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GYPAP02724 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GYPAP02724 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GYPAP02724 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GYPAP02724 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GYPAP02724 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GYPAP02724 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GYPAP02724 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GYPAP02724 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GYPAP02724 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GYPAP02724 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GYPAP02724 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GYPAP02724 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GYPAP02724 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GYPAP02724 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GYPAP02724 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GYPAP02724 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GYPAP02724 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GYPAP02724 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GYPAP02724 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GYPAP02724 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GYPAP02724 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GYPAP02724 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GYPAP02724 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GYPAP02724 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GYPAP02724 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GYPAP02724 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GYPAP02724 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GYPAP02724 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GYPAP02724 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GYPAP02724 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GYPAP02724 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GYPAP02724 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GYPAP02724 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GYPAP02724 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GYPAP02724 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GYPAP02724 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GYPAP02724 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GYPAP02724 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GYPAP02724 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GYPAP02724 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GYPAP02724 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GYPAP02724 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GYPAP02724 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GYPAP02724 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GYPAP02724 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GYPAP02724 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GYPAP02724 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GYPAP02724 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GYPAP02724 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GYPAP02724 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GYPAP02724 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GYPAP02724 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GYPAP02724 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GYPAP02724 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GYPAP02724 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GYPAP02724 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GYPAP02724 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GYPAP02724 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GYPAP02724 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GYPAP02724 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GYPAP02724 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GYPAP02724 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GYPAP02724 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GYPAP02724 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms