Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.74■■■■□ 3.79
CCNE2O96020 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CCNE2O96020 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CCNE2O96020 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CCNE2O96020 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CCNE2O96020 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CCNE2O96020 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
CCNE2O96020 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CCNE2O96020 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CCNE2O96020 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CCNE2O96020 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CCNE2O96020 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CCNE2O96020 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCNE2O96020 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCNE2O96020 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CCNE2O96020 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CCNE2O96020 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CCNE2O96020 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CCNE2O96020 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CCNE2O96020 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CCNE2O96020 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CCNE2O96020 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CCNE2O96020 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CCNE2O96020 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CCNE2O96020 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCNE2O96020 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCNE2O96020 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CCNE2O96020 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CCNE2O96020 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CCNE2O96020 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCNE2O96020 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CCNE2O96020 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CCNE2O96020 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCNE2O96020 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCNE2O96020 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CCNE2O96020 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CCNE2O96020 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CCNE2O96020 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CCNE2O96020 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCNE2O96020 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
CCNE2O96020 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCNE2O96020 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCNE2O96020 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCNE2O96020 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCNE2O96020 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCNE2O96020 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCNE2O96020 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCNE2O96020 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CCNE2O96020 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCNE2O96020 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCNE2O96020 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCNE2O96020 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
CCNE2O96020 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CCNE2O96020 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CCNE2O96020 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CCNE2O96020 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
CCNE2O96020 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCNE2O96020 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCNE2O96020 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCNE2O96020 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCNE2O96020 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCNE2O96020 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCNE2O96020 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCNE2O96020 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCNE2O96020 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCNE2O96020 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCNE2O96020 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCNE2O96020 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCNE2O96020 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCNE2O96020 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCNE2O96020 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCNE2O96020 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCNE2O96020 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCNE2O96020 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCNE2O96020 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CCNE2O96020 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CCNE2O96020 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CCNE2O96020 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
CCNE2O96020 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCNE2O96020 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CCNE2O96020 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCNE2O96020 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCNE2O96020 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCNE2O96020 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CCNE2O96020 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCNE2O96020 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCNE2O96020 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CCNE2O96020 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCNE2O96020 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCNE2O96020 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCNE2O96020 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CCNE2O96020 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCNE2O96020 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCNE2O96020 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCNE2O96020 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCNE2O96020 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
CCNE2O96020 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CCNE2O96020 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CCNE2O96020 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCNE2O96020 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 6.9 ms