Protein–RNA interactions for Protein: O95782

AP2A1, AP-2 complex subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2A1O95782 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
AP2A1O95782 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
AP2A1O95782 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
AP2A1O95782 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
AP2A1O95782 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
AP2A1O95782 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
AP2A1O95782 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
AP2A1O95782 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
AP2A1O95782 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
AP2A1O95782 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
AP2A1O95782 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
AP2A1O95782 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
AP2A1O95782 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
AP2A1O95782 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
AP2A1O95782 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
AP2A1O95782 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
AP2A1O95782 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
AP2A1O95782 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
AP2A1O95782 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
AP2A1O95782 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
AP2A1O95782 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
AP2A1O95782 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
AP2A1O95782 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
AP2A1O95782 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
AP2A1O95782 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
AP2A1O95782 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
AP2A1O95782 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
AP2A1O95782 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
AP2A1O95782 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
AP2A1O95782 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
AP2A1O95782 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
AP2A1O95782 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
AP2A1O95782 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
AP2A1O95782 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
AP2A1O95782 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
AP2A1O95782 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
AP2A1O95782 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
AP2A1O95782 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
AP2A1O95782 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
AP2A1O95782 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
AP2A1O95782 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
AP2A1O95782 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
AP2A1O95782 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
AP2A1O95782 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
AP2A1O95782 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
AP2A1O95782 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
AP2A1O95782 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
AP2A1O95782 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
AP2A1O95782 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
AP2A1O95782 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
AP2A1O95782 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
AP2A1O95782 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
AP2A1O95782 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
AP2A1O95782 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
AP2A1O95782 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
AP2A1O95782 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
AP2A1O95782 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
AP2A1O95782 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
AP2A1O95782 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
AP2A1O95782 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
AP2A1O95782 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
AP2A1O95782 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
AP2A1O95782 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
AP2A1O95782 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
AP2A1O95782 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
AP2A1O95782 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
AP2A1O95782 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
AP2A1O95782 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
AP2A1O95782 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
AP2A1O95782 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
AP2A1O95782 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
AP2A1O95782 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
AP2A1O95782 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
AP2A1O95782 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
AP2A1O95782 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
AP2A1O95782 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
AP2A1O95782 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
AP2A1O95782 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
AP2A1O95782 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
AP2A1O95782 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
AP2A1O95782 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
AP2A1O95782 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
AP2A1O95782 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
AP2A1O95782 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
AP2A1O95782 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
AP2A1O95782 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
AP2A1O95782 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
AP2A1O95782 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
AP2A1O95782 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
AP2A1O95782 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
AP2A1O95782 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
AP2A1O95782 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
AP2A1O95782 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
AP2A1O95782 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
AP2A1O95782 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
AP2A1O95782 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
AP2A1O95782 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
AP2A1O95782 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
AP2A1O95782 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
AP2A1O95782 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms