Protein–RNA interactions for Protein: O60688

YPEL1, Protein yippee-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YPEL1O60688 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
YPEL1O60688 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
YPEL1O60688 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
YPEL1O60688 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
YPEL1O60688 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
YPEL1O60688 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
YPEL1O60688 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
YPEL1O60688 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
YPEL1O60688 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
YPEL1O60688 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
YPEL1O60688 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
YPEL1O60688 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
YPEL1O60688 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
YPEL1O60688 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
YPEL1O60688 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YPEL1O60688 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
YPEL1O60688 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
YPEL1O60688 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
YPEL1O60688 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YPEL1O60688 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
YPEL1O60688 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
YPEL1O60688 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
YPEL1O60688 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
YPEL1O60688 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
YPEL1O60688 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
YPEL1O60688 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
YPEL1O60688 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
YPEL1O60688 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
YPEL1O60688 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
YPEL1O60688 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
YPEL1O60688 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
YPEL1O60688 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
YPEL1O60688 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
YPEL1O60688 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
YPEL1O60688 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YPEL1O60688 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
YPEL1O60688 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
YPEL1O60688 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
YPEL1O60688 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
YPEL1O60688 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
YPEL1O60688 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
YPEL1O60688 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
YPEL1O60688 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
YPEL1O60688 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
YPEL1O60688 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YPEL1O60688 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YPEL1O60688 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YPEL1O60688 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
YPEL1O60688 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
YPEL1O60688 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
YPEL1O60688 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
YPEL1O60688 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
YPEL1O60688 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YPEL1O60688 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YPEL1O60688 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YPEL1O60688 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
YPEL1O60688 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YPEL1O60688 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YPEL1O60688 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YPEL1O60688 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YPEL1O60688 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YPEL1O60688 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YPEL1O60688 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YPEL1O60688 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
YPEL1O60688 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
YPEL1O60688 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
YPEL1O60688 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
YPEL1O60688 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YPEL1O60688 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YPEL1O60688 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YPEL1O60688 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YPEL1O60688 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YPEL1O60688 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YPEL1O60688 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YPEL1O60688 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
YPEL1O60688 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
YPEL1O60688 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YPEL1O60688 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YPEL1O60688 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YPEL1O60688 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YPEL1O60688 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YPEL1O60688 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
YPEL1O60688 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YPEL1O60688 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
YPEL1O60688 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
YPEL1O60688 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
YPEL1O60688 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YPEL1O60688 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YPEL1O60688 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
YPEL1O60688 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
YPEL1O60688 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
YPEL1O60688 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
YPEL1O60688 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
YPEL1O60688 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
YPEL1O60688 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
YPEL1O60688 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
YPEL1O60688 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
YPEL1O60688 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
YPEL1O60688 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YPEL1O60688 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms