Protein–RNA interactions for Protein: O60543

CIDEA, Cell death activator CIDE-A, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIDEAO60543 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CIDEAO60543 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CIDEAO60543 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CIDEAO60543 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CIDEAO60543 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CIDEAO60543 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CIDEAO60543 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CIDEAO60543 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIDEAO60543 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CIDEAO60543 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CIDEAO60543 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CIDEAO60543 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CIDEAO60543 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CIDEAO60543 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CIDEAO60543 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIDEAO60543 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CIDEAO60543 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIDEAO60543 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIDEAO60543 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIDEAO60543 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIDEAO60543 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIDEAO60543 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CIDEAO60543 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CIDEAO60543 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIDEAO60543 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIDEAO60543 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIDEAO60543 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIDEAO60543 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIDEAO60543 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CIDEAO60543 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CIDEAO60543 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIDEAO60543 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIDEAO60543 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIDEAO60543 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIDEAO60543 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIDEAO60543 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIDEAO60543 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIDEAO60543 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CIDEAO60543 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CIDEAO60543 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CIDEAO60543 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CIDEAO60543 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CIDEAO60543 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CIDEAO60543 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CIDEAO60543 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CIDEAO60543 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CIDEAO60543 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CIDEAO60543 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CIDEAO60543 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CIDEAO60543 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CIDEAO60543 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CIDEAO60543 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CIDEAO60543 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CIDEAO60543 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CIDEAO60543 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CIDEAO60543 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CIDEAO60543 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CIDEAO60543 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CIDEAO60543 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CIDEAO60543 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CIDEAO60543 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CIDEAO60543 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CIDEAO60543 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CIDEAO60543 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIDEAO60543 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIDEAO60543 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CIDEAO60543 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CIDEAO60543 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIDEAO60543 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIDEAO60543 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CIDEAO60543 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CIDEAO60543 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIDEAO60543 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CIDEAO60543 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CIDEAO60543 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CIDEAO60543 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CIDEAO60543 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CIDEAO60543 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CIDEAO60543 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CIDEAO60543 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CIDEAO60543 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CIDEAO60543 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CIDEAO60543 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CIDEAO60543 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CIDEAO60543 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CIDEAO60543 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CIDEAO60543 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CIDEAO60543 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CIDEAO60543 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CIDEAO60543 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CIDEAO60543 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CIDEAO60543 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CIDEAO60543 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CIDEAO60543 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CIDEAO60543 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CIDEAO60543 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CIDEAO60543 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CIDEAO60543 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CIDEAO60543 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CIDEAO60543 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.1 ms