Protein–RNA interactions for Protein: O43379

WDR62, WD repeat-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 1,518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR62O43379 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC60.41■■■■■ 7.26
WDR62O43379 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC59.74■■■■■ 7.15
WDR62O43379 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC59.72■■■■■ 7.15
WDR62O43379 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.6■■■■■ 6.97
WDR62O43379 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC57.88■■■■■ 6.86
WDR62O43379 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.75■■■■■ 6.84
WDR62O43379 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC57.57■■■■■ 6.81
WDR62O43379 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.56■■■■■ 6.81
WDR62O43379 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC57.55■■■■■ 6.8
WDR62O43379 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC57.54■■■■■ 6.8
WDR62O43379 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC57.04■■■■■ 6.72
WDR62O43379 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC56.99■■■■■ 6.71
WDR62O43379 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC56.84■■■■■ 6.69
WDR62O43379 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.79■■■■■ 6.68
WDR62O43379 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC56.63■■■■■ 6.66
WDR62O43379 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.6■■■■■ 6.65
WDR62O43379 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC56.25■■■■■ 6.59
WDR62O43379 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.07■■■■■ 6.57
WDR62O43379 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC55.84■■■■■ 6.53
WDR62O43379 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.77■■■■■ 6.52
WDR62O43379 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC55.77■■■■■ 6.52
WDR62O43379 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC55.68■■■■■ 6.5
WDR62O43379 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC55.64■■■■■ 6.5
WDR62O43379 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.51■■■■■ 6.48
WDR62O43379 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC55.48■■■■■ 6.47
WDR62O43379 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC55.45■■■■■ 6.47
WDR62O43379 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC55.32■■■■■ 6.45
WDR62O43379 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC55.23■■■■■ 6.43
WDR62O43379 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC55.16■■■■■ 6.42
WDR62O43379 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC55.12■■■■■ 6.41
WDR62O43379 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.9■■■■■ 6.38
WDR62O43379 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC54.78■■■■■ 6.36
WDR62O43379 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC54.54■■■■■ 6.32
WDR62O43379 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC54.39■■■■■ 6.3
WDR62O43379 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC54.3■■■■■ 6.28
WDR62O43379 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC54.14■■■■■ 6.26
WDR62O43379 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.89■■■■■ 6.22
WDR62O43379 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.88■■■■■ 6.22
WDR62O43379 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC53.65■■■■■ 6.18
WDR62O43379 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC53.64■■■■■ 6.18
WDR62O43379 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC53.61■■■■■ 6.17
WDR62O43379 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC53.41■■■■■ 6.14
WDR62O43379 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC53.41■■■■■ 6.14
WDR62O43379 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.36■■■■■ 6.13
WDR62O43379 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC53.36■■■■■ 6.13
WDR62O43379 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC53.36■■■■■ 6.13
WDR62O43379 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC53.32■■■■■ 6.13
WDR62O43379 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.3■■■■■ 6.12
WDR62O43379 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC53.18■■■■■ 6.1
WDR62O43379 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC53.16■■■■■ 6.1
WDR62O43379 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC53.15■■■■■ 6.1
WDR62O43379 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC53.15■■■■■ 6.1
WDR62O43379 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC53.12■■■■■ 6.09
WDR62O43379 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC53.11■■■■■ 6.09
WDR62O43379 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.11■■■■■ 6.09
WDR62O43379 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC52.98■■■■■ 6.07
WDR62O43379 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC52.98■■■■■ 6.07
WDR62O43379 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.91■■■■■ 6.06
WDR62O43379 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC52.9■■■■■ 6.06
WDR62O43379 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC52.88■■■■■ 6.06
WDR62O43379 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC52.87■■■■■ 6.05
WDR62O43379 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC52.85■■■■■ 6.05
WDR62O43379 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.75■■■■■ 6.03
WDR62O43379 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.69■■■■■ 6.02
WDR62O43379 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.52■■■■■ 6
WDR62O43379 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC52.46■■■■■ 5.99
WDR62O43379 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC52.45■■■■■ 5.99
WDR62O43379 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC52.43■■■■■ 5.98
WDR62O43379 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.41■■■■■ 5.98
WDR62O43379 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.33■■■■■ 5.97
WDR62O43379 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC52.32■■■■■ 5.97
WDR62O43379 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC52.29■■■■■ 5.96
WDR62O43379 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC52.23■■■■■ 5.95
WDR62O43379 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC52.2■■■■■ 5.95
WDR62O43379 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.18■■■■■ 5.94
WDR62O43379 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC52.18■■■■■ 5.94
WDR62O43379 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.17■■■■■ 5.94
WDR62O43379 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.15■■■■■ 5.94
WDR62O43379 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC52.13■■■■■ 5.94
WDR62O43379 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC52.11■■■■■ 5.93
WDR62O43379 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC52.07■■■■■ 5.93
WDR62O43379 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC52.03■■■■■ 5.92
WDR62O43379 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.01■■■■■ 5.92
WDR62O43379 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.99■■■■■ 5.91
WDR62O43379 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC51.97■■■■■ 5.91
WDR62O43379 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC51.96■■■■■ 5.91
WDR62O43379 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC51.95■■■■■ 5.91
WDR62O43379 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.91■■■■■ 5.9
WDR62O43379 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.9■■■■■ 5.9
WDR62O43379 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.89■■■■■ 5.9
WDR62O43379 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC51.88■■■■■ 5.9
WDR62O43379 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC51.88■■■■■ 5.9
WDR62O43379 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC51.83■■■■■ 5.89
WDR62O43379 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.83■■■■■ 5.89
WDR62O43379 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC51.82■■■■■ 5.89
WDR62O43379 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC51.82■■■■■ 5.89
WDR62O43379 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.78■■■■■ 5.88
WDR62O43379 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC51.77■■■■■ 5.88
WDR62O43379 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC51.77■■■■■ 5.88
WDR62O43379 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC51.71■■■■■ 5.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms