Protein–RNA interactions for Protein: O14830

PPEF2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPEF2O14830 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PPEF2O14830 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PPEF2O14830 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PPEF2O14830 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PPEF2O14830 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
PPEF2O14830 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PPEF2O14830 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PPEF2O14830 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PPEF2O14830 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PPEF2O14830 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PPEF2O14830 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PPEF2O14830 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PPEF2O14830 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PPEF2O14830 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PPEF2O14830 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PPEF2O14830 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PPEF2O14830 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PPEF2O14830 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PPEF2O14830 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PPEF2O14830 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PPEF2O14830 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PPEF2O14830 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PPEF2O14830 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PPEF2O14830 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PPEF2O14830 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PPEF2O14830 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PPEF2O14830 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PPEF2O14830 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PPEF2O14830 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PPEF2O14830 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PPEF2O14830 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PPEF2O14830 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PPEF2O14830 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PPEF2O14830 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PPEF2O14830 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PPEF2O14830 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PPEF2O14830 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PPEF2O14830 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PPEF2O14830 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PPEF2O14830 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PPEF2O14830 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PPEF2O14830 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PPEF2O14830 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PPEF2O14830 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PPEF2O14830 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
PPEF2O14830 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PPEF2O14830 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PPEF2O14830 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PPEF2O14830 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PPEF2O14830 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PPEF2O14830 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PPEF2O14830 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PPEF2O14830 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PPEF2O14830 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PPEF2O14830 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
PPEF2O14830 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
PPEF2O14830 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PPEF2O14830 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PPEF2O14830 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PPEF2O14830 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
PPEF2O14830 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PPEF2O14830 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PPEF2O14830 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PPEF2O14830 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PPEF2O14830 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PPEF2O14830 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PPEF2O14830 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PPEF2O14830 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PPEF2O14830 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PPEF2O14830 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PPEF2O14830 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PPEF2O14830 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PPEF2O14830 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PPEF2O14830 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PPEF2O14830 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PPEF2O14830 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PPEF2O14830 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PPEF2O14830 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PPEF2O14830 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PPEF2O14830 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PPEF2O14830 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PPEF2O14830 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PPEF2O14830 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PPEF2O14830 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
PPEF2O14830 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PPEF2O14830 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PPEF2O14830 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PPEF2O14830 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PPEF2O14830 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PPEF2O14830 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PPEF2O14830 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PPEF2O14830 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PPEF2O14830 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PPEF2O14830 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PPEF2O14830 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PPEF2O14830 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PPEF2O14830 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PPEF2O14830 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PPEF2O14830 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
PPEF2O14830 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms