Protein–RNA interactions for Protein: I3L0E3

hCG_1984214, HCG1984214, isoform CRA_a, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
hCG_1984214I3L0E3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.47■■■■□ 3.91
hCG_1984214I3L0E3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
hCG_1984214I3L0E3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
hCG_1984214I3L0E3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
hCG_1984214I3L0E3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
hCG_1984214I3L0E3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
hCG_1984214I3L0E3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.68
hCG_1984214I3L0E3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
hCG_1984214I3L0E3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
hCG_1984214I3L0E3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
hCG_1984214I3L0E3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
hCG_1984214I3L0E3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
hCG_1984214I3L0E3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
hCG_1984214I3L0E3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
hCG_1984214I3L0E3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
hCG_1984214I3L0E3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
hCG_1984214I3L0E3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
hCG_1984214I3L0E3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
hCG_1984214I3L0E3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
hCG_1984214I3L0E3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
hCG_1984214I3L0E3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
hCG_1984214I3L0E3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
hCG_1984214I3L0E3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
hCG_1984214I3L0E3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
hCG_1984214I3L0E3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
hCG_1984214I3L0E3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
hCG_1984214I3L0E3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
hCG_1984214I3L0E3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
hCG_1984214I3L0E3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
hCG_1984214I3L0E3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
hCG_1984214I3L0E3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
hCG_1984214I3L0E3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
hCG_1984214I3L0E3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
hCG_1984214I3L0E3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
hCG_1984214I3L0E3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
hCG_1984214I3L0E3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
hCG_1984214I3L0E3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
hCG_1984214I3L0E3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
hCG_1984214I3L0E3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
hCG_1984214I3L0E3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
hCG_1984214I3L0E3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
hCG_1984214I3L0E3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
hCG_1984214I3L0E3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
hCG_1984214I3L0E3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
hCG_1984214I3L0E3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
hCG_1984214I3L0E3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
hCG_1984214I3L0E3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
hCG_1984214I3L0E3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
hCG_1984214I3L0E3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
hCG_1984214I3L0E3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
hCG_1984214I3L0E3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
hCG_1984214I3L0E3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
hCG_1984214I3L0E3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
hCG_1984214I3L0E3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
hCG_1984214I3L0E3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
hCG_1984214I3L0E3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
hCG_1984214I3L0E3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
hCG_1984214I3L0E3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
hCG_1984214I3L0E3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
hCG_1984214I3L0E3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
hCG_1984214I3L0E3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
hCG_1984214I3L0E3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
hCG_1984214I3L0E3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
hCG_1984214I3L0E3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
hCG_1984214I3L0E3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
hCG_1984214I3L0E3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
hCG_1984214I3L0E3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
hCG_1984214I3L0E3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
hCG_1984214I3L0E3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
hCG_1984214I3L0E3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
hCG_1984214I3L0E3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
hCG_1984214I3L0E3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
hCG_1984214I3L0E3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
hCG_1984214I3L0E3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
hCG_1984214I3L0E3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
hCG_1984214I3L0E3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
hCG_1984214I3L0E3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
hCG_1984214I3L0E3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
hCG_1984214I3L0E3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
hCG_1984214I3L0E3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
hCG_1984214I3L0E3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
hCG_1984214I3L0E3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
hCG_1984214I3L0E3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
hCG_1984214I3L0E3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
hCG_1984214I3L0E3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
hCG_1984214I3L0E3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
hCG_1984214I3L0E3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
hCG_1984214I3L0E3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
hCG_1984214I3L0E3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
hCG_1984214I3L0E3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
hCG_1984214I3L0E3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
hCG_1984214I3L0E3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
hCG_1984214I3L0E3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
hCG_1984214I3L0E3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
hCG_1984214I3L0E3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
hCG_1984214I3L0E3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
hCG_1984214I3L0E3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
hCG_1984214I3L0E3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
hCG_1984214I3L0E3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
hCG_1984214I3L0E3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms