Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
B4DXG7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
B4DXG7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
B4DXG7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
B4DXG7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
B4DXG7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
B4DXG7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
B4DXG7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
B4DXG7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
B4DXG7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
B4DXG7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
B4DXG7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
B4DXG7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
B4DXG7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
B4DXG7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
B4DXG7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
B4DXG7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
B4DXG7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
B4DXG7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
B4DXG7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
B4DXG7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
B4DXG7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
B4DXG7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
B4DXG7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
B4DXG7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
B4DXG7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
B4DXG7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
B4DXG7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
B4DXG7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
B4DXG7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
B4DXG7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
B4DXG7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
B4DXG7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
B4DXG7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
B4DXG7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
B4DXG7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
B4DXG7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
B4DXG7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
B4DXG7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
B4DXG7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
B4DXG7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
B4DXG7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
B4DXG7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
B4DXG7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
B4DXG7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
B4DXG7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
B4DXG7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
B4DXG7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
B4DXG7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
B4DXG7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
B4DXG7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
B4DXG7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
B4DXG7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
B4DXG7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
B4DXG7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
B4DXG7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
B4DXG7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
B4DXG7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
B4DXG7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
B4DXG7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
B4DXG7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
B4DXG7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
B4DXG7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
B4DXG7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
B4DXG7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
B4DXG7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
B4DXG7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
B4DXG7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
B4DXG7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
B4DXG7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
B4DXG7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
B4DXG7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27■■□□□ 1.91
B4DXG7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
B4DXG7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
B4DXG7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
B4DXG7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
B4DXG7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
B4DXG7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
B4DXG7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
B4DXG7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
B4DXG7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
B4DXG7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
B4DXG7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
B4DXG7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
B4DXG7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
B4DXG7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
B4DXG7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
B4DXG7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
B4DXG7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
B4DXG7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
B4DXG7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
B4DXG7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
B4DXG7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
B4DXG7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
B4DXG7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
B4DXG7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
B4DXG7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
B4DXG7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
B4DXG7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
B4DXG7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms