Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN8

Putative ubiquitin-like protein FUBI-like protein ENSP00000310146, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NDN8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
A6NDN8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A6NDN8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
A6NDN8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A6NDN8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NDN8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NDN8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A6NDN8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A6NDN8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A6NDN8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
A6NDN8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A6NDN8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A6NDN8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A6NDN8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A6NDN8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NDN8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A6NDN8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NDN8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NDN8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A6NDN8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A6NDN8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A6NDN8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A6NDN8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A6NDN8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A6NDN8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A6NDN8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A6NDN8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A6NDN8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A6NDN8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A6NDN8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A6NDN8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A6NDN8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A6NDN8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A6NDN8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
A6NDN8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
A6NDN8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
A6NDN8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A6NDN8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A6NDN8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A6NDN8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A6NDN8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A6NDN8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A6NDN8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A6NDN8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A6NDN8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A6NDN8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A6NDN8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A6NDN8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A6NDN8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A6NDN8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A6NDN8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A6NDN8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A6NDN8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A6NDN8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A6NDN8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A6NDN8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A6NDN8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A6NDN8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A6NDN8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A6NDN8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A6NDN8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A6NDN8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A6NDN8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A6NDN8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A6NDN8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A6NDN8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A6NDN8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
A6NDN8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A6NDN8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
A6NDN8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A6NDN8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
A6NDN8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A6NDN8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
A6NDN8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
A6NDN8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A6NDN8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
A6NDN8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
A6NDN8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
A6NDN8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
A6NDN8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
A6NDN8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
A6NDN8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
A6NDN8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
A6NDN8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
A6NDN8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
A6NDN8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
A6NDN8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
A6NDN8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
A6NDN8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
A6NDN8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
A6NDN8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
A6NDN8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
A6NDN8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
A6NDN8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
A6NDN8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
A6NDN8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
A6NDN8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
A6NDN8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
A6NDN8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
A6NDN8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms