Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC50.29■■■■■ 5.64
CCDC144AA2RUR9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC49.13■■■■■ 5.46
CCDC144AA2RUR9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.9■■■■■ 5.42
CCDC144AA2RUR9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.85■■■■■ 5.41
CCDC144AA2RUR9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.69■■■■■ 5.38
CCDC144AA2RUR9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.62■■■■■ 5.37
CCDC144AA2RUR9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC48.44■■■■■ 5.35
CCDC144AA2RUR9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.28■■■■■ 5.32
CCDC144AA2RUR9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
CCDC144AA2RUR9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC47.23■■■■■ 5.15
CCDC144AA2RUR9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.08■■■■■ 5.13
CCDC144AA2RUR9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC47.04■■■■■ 5.12
CCDC144AA2RUR9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.99■■■■■ 5.11
CCDC144AA2RUR9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC46.92■■■■■ 5.1
CCDC144AA2RUR9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC46.86■■■■■ 5.09
CCDC144AA2RUR9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC46.8■■■■■ 5.08
CCDC144AA2RUR9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.04
CCDC144AA2RUR9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC46.48■■■■■ 5.03
CCDC144AA2RUR9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
CCDC144AA2RUR9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
CCDC144AA2RUR9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.13■■■■■ 4.98
CCDC144AA2RUR9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
CCDC144AA2RUR9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
CCDC144AA2RUR9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC45.66■■■■■ 4.9
CCDC144AA2RUR9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
CCDC144AA2RUR9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
CCDC144AA2RUR9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
CCDC144AA2RUR9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC45.41■■■■■ 4.86
CCDC144AA2RUR9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
CCDC144AA2RUR9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
CCDC144AA2RUR9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC45.2■■■■■ 4.83
CCDC144AA2RUR9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.12■■■■■ 4.81
CCDC144AA2RUR9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
CCDC144AA2RUR9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
CCDC144AA2RUR9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC44.87■■■■■ 4.77
CCDC144AA2RUR9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
CCDC144AA2RUR9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
CCDC144AA2RUR9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
CCDC144AA2RUR9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC44.61■■■■■ 4.73
CCDC144AA2RUR9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC44.58■■■■■ 4.73
CCDC144AA2RUR9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.46■■■■■ 4.71
CCDC144AA2RUR9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
CCDC144AA2RUR9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC44.43■■■■■ 4.7
CCDC144AA2RUR9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC44.42■■■■■ 4.7
CCDC144AA2RUR9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC44.33■■■■■ 4.69
CCDC144AA2RUR9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
CCDC144AA2RUR9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC44.09■■■■■ 4.65
CCDC144AA2RUR9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
CCDC144AA2RUR9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.05■■■■■ 4.64
CCDC144AA2RUR9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC44■■■■■ 4.63
CCDC144AA2RUR9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.94■■■■■ 4.63
CCDC144AA2RUR9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
CCDC144AA2RUR9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
CCDC144AA2RUR9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.79■■■■■ 4.6
CCDC144AA2RUR9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC43.79■■■■■ 4.6
CCDC144AA2RUR9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
CCDC144AA2RUR9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
CCDC144AA2RUR9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.62■■■■■ 4.57
CCDC144AA2RUR9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.59■■■■■ 4.57
CCDC144AA2RUR9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
CCDC144AA2RUR9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
CCDC144AA2RUR9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
CCDC144AA2RUR9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC43.43■■■■■ 4.54
CCDC144AA2RUR9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC43.33■■■■■ 4.53
CCDC144AA2RUR9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC43.31■■■■■ 4.52
CCDC144AA2RUR9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
CCDC144AA2RUR9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC43.25■■■■■ 4.51
CCDC144AA2RUR9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC43.2■■■■■ 4.51
CCDC144AA2RUR9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
CCDC144AA2RUR9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
CCDC144AA2RUR9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
CCDC144AA2RUR9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
CCDC144AA2RUR9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.06■■■■■ 4.48
CCDC144AA2RUR9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
CCDC144AA2RUR9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
CCDC144AA2RUR9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
CCDC144AA2RUR9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
CCDC144AA2RUR9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC42.94■■■■■ 4.46
CCDC144AA2RUR9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC42.9■■■■■ 4.46
CCDC144AA2RUR9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
CCDC144AA2RUR9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC42.82■■■■■ 4.45
CCDC144AA2RUR9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
CCDC144AA2RUR9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC42.79■■■■■ 4.44
CCDC144AA2RUR9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
CCDC144AA2RUR9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.77■■■■■ 4.44
CCDC144AA2RUR9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC42.75■■■■■ 4.43
CCDC144AA2RUR9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
CCDC144AA2RUR9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
CCDC144AA2RUR9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC42.72■■■■■ 4.43
CCDC144AA2RUR9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
CCDC144AA2RUR9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
CCDC144AA2RUR9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC42.66■■■■■ 4.42
CCDC144AA2RUR9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC42.61■■■■■ 4.41
CCDC144AA2RUR9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC42.59■■■■■ 4.41
CCDC144AA2RUR9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
CCDC144AA2RUR9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
CCDC144AA2RUR9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
CCDC144AA2RUR9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
CCDC144AA2RUR9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
CCDC144AA2RUR9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms