Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J265

TRAV26-2, T-cell receptor alpha variable 26-2 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV26-2A0A0B4J265 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAV26-2A0A0B4J265 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAV26-2A0A0B4J265 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAV26-2A0A0B4J265 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAV26-2A0A0B4J265 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAV26-2A0A0B4J265 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAV26-2A0A0B4J265 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAV26-2A0A0B4J265 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAV26-2A0A0B4J265 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAV26-2A0A0B4J265 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAV26-2A0A0B4J265 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAV26-2A0A0B4J265 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAV26-2A0A0B4J265 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAV26-2A0A0B4J265 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAV26-2A0A0B4J265 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAV26-2A0A0B4J265 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAV26-2A0A0B4J265 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAV26-2A0A0B4J265 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAV26-2A0A0B4J265 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAV26-2A0A0B4J265 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAV26-2A0A0B4J265 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAV26-2A0A0B4J265 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAV26-2A0A0B4J265 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAV26-2A0A0B4J265 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAV26-2A0A0B4J265 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAV26-2A0A0B4J265 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAV26-2A0A0B4J265 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAV26-2A0A0B4J265 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRAV26-2A0A0B4J265 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAV26-2A0A0B4J265 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAV26-2A0A0B4J265 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAV26-2A0A0B4J265 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAV26-2A0A0B4J265 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAV26-2A0A0B4J265 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAV26-2A0A0B4J265 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAV26-2A0A0B4J265 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAV26-2A0A0B4J265 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAV26-2A0A0B4J265 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAV26-2A0A0B4J265 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAV26-2A0A0B4J265 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAV26-2A0A0B4J265 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAV26-2A0A0B4J265 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAV26-2A0A0B4J265 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAV26-2A0A0B4J265 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAV26-2A0A0B4J265 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAV26-2A0A0B4J265 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRAV26-2A0A0B4J265 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAV26-2A0A0B4J265 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAV26-2A0A0B4J265 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAV26-2A0A0B4J265 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAV26-2A0A0B4J265 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAV26-2A0A0B4J265 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAV26-2A0A0B4J265 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAV26-2A0A0B4J265 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAV26-2A0A0B4J265 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAV26-2A0A0B4J265 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAV26-2A0A0B4J265 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAV26-2A0A0B4J265 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAV26-2A0A0B4J265 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAV26-2A0A0B4J265 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAV26-2A0A0B4J265 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAV26-2A0A0B4J265 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAV26-2A0A0B4J265 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAV26-2A0A0B4J265 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAV26-2A0A0B4J265 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAV26-2A0A0B4J265 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAV26-2A0A0B4J265 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAV26-2A0A0B4J265 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAV26-2A0A0B4J265 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAV26-2A0A0B4J265 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAV26-2A0A0B4J265 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAV26-2A0A0B4J265 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAV26-2A0A0B4J265 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAV26-2A0A0B4J265 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAV26-2A0A0B4J265 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAV26-2A0A0B4J265 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAV26-2A0A0B4J265 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAV26-2A0A0B4J265 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAV26-2A0A0B4J265 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAV26-2A0A0B4J265 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAV26-2A0A0B4J265 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAV26-2A0A0B4J265 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAV26-2A0A0B4J265 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAV26-2A0A0B4J265 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAV26-2A0A0B4J265 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAV26-2A0A0B4J265 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAV26-2A0A0B4J265 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAV26-2A0A0B4J265 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAV26-2A0A0B4J265 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAV26-2A0A0B4J265 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAV26-2A0A0B4J265 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAV26-2A0A0B4J265 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAV26-2A0A0B4J265 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAV26-2A0A0B4J265 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAV26-2A0A0B4J265 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAV26-2A0A0B4J265 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRAV26-2A0A0B4J265 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAV26-2A0A0B4J265 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAV26-2A0A0B4J265 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAV26-2A0A0B4J265 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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