Protein–RNA interactions for Protein: U3KQV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQV3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
U3KQV3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
U3KQV3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
U3KQV3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
U3KQV3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
U3KQV3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
U3KQV3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
U3KQV3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
U3KQV3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
U3KQV3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
U3KQV3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
U3KQV3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
U3KQV3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
U3KQV3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
U3KQV3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
U3KQV3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
U3KQV3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
U3KQV3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
U3KQV3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
U3KQV3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
U3KQV3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
U3KQV3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
U3KQV3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
U3KQV3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
U3KQV3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
U3KQV3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
U3KQV3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
U3KQV3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
U3KQV3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
U3KQV3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U3KQV3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U3KQV3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U3KQV3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U3KQV3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U3KQV3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U3KQV3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U3KQV3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U3KQV3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U3KQV3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
U3KQV3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U3KQV3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
U3KQV3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
U3KQV3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
U3KQV3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U3KQV3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U3KQV3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
U3KQV3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
U3KQV3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
U3KQV3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U3KQV3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
U3KQV3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
U3KQV3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
U3KQV3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U3KQV3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
U3KQV3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U3KQV3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
U3KQV3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U3KQV3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
U3KQV3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U3KQV3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U3KQV3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U3KQV3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U3KQV3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
U3KQV3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
U3KQV3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
U3KQV3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
U3KQV3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U3KQV3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U3KQV3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U3KQV3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U3KQV3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
U3KQV3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
U3KQV3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U3KQV3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
U3KQV3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U3KQV3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U3KQV3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
U3KQV3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
U3KQV3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U3KQV3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U3KQV3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
U3KQV3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
U3KQV3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
U3KQV3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
U3KQV3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
U3KQV3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U3KQV3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U3KQV3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U3KQV3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U3KQV3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U3KQV3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U3KQV3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
U3KQV3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
U3KQV3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
U3KQV3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
U3KQV3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
U3KQV3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
U3KQV3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
U3KQV3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
U3KQV3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms