Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B0

CTDP1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1Q9Y5B0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CTDP1Q9Y5B0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CTDP1Q9Y5B0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CTDP1Q9Y5B0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CTDP1Q9Y5B0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CTDP1Q9Y5B0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CTDP1Q9Y5B0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CTDP1Q9Y5B0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CTDP1Q9Y5B0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTDP1Q9Y5B0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTDP1Q9Y5B0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTDP1Q9Y5B0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTDP1Q9Y5B0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTDP1Q9Y5B0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTDP1Q9Y5B0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTDP1Q9Y5B0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTDP1Q9Y5B0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTDP1Q9Y5B0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTDP1Q9Y5B0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTDP1Q9Y5B0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTDP1Q9Y5B0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTDP1Q9Y5B0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CTDP1Q9Y5B0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CTDP1Q9Y5B0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CTDP1Q9Y5B0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CTDP1Q9Y5B0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CTDP1Q9Y5B0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CTDP1Q9Y5B0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CTDP1Q9Y5B0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CTDP1Q9Y5B0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CTDP1Q9Y5B0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CTDP1Q9Y5B0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CTDP1Q9Y5B0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CTDP1Q9Y5B0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CTDP1Q9Y5B0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CTDP1Q9Y5B0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CTDP1Q9Y5B0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CTDP1Q9Y5B0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CTDP1Q9Y5B0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CTDP1Q9Y5B0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CTDP1Q9Y5B0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CTDP1Q9Y5B0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CTDP1Q9Y5B0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CTDP1Q9Y5B0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CTDP1Q9Y5B0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CTDP1Q9Y5B0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTDP1Q9Y5B0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTDP1Q9Y5B0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTDP1Q9Y5B0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTDP1Q9Y5B0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTDP1Q9Y5B0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTDP1Q9Y5B0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTDP1Q9Y5B0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTDP1Q9Y5B0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTDP1Q9Y5B0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTDP1Q9Y5B0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTDP1Q9Y5B0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CTDP1Q9Y5B0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CTDP1Q9Y5B0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CTDP1Q9Y5B0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CTDP1Q9Y5B0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTDP1Q9Y5B0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTDP1Q9Y5B0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTDP1Q9Y5B0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTDP1Q9Y5B0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTDP1Q9Y5B0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CTDP1Q9Y5B0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CTDP1Q9Y5B0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CTDP1Q9Y5B0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CTDP1Q9Y5B0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CTDP1Q9Y5B0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CTDP1Q9Y5B0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CTDP1Q9Y5B0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CTDP1Q9Y5B0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CTDP1Q9Y5B0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CTDP1Q9Y5B0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CTDP1Q9Y5B0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CTDP1Q9Y5B0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTDP1Q9Y5B0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTDP1Q9Y5B0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTDP1Q9Y5B0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTDP1Q9Y5B0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTDP1Q9Y5B0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTDP1Q9Y5B0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTDP1Q9Y5B0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTDP1Q9Y5B0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTDP1Q9Y5B0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTDP1Q9Y5B0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTDP1Q9Y5B0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTDP1Q9Y5B0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTDP1Q9Y5B0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTDP1Q9Y5B0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTDP1Q9Y5B0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CTDP1Q9Y5B0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CTDP1Q9Y5B0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CTDP1Q9Y5B0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CTDP1Q9Y5B0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CTDP1Q9Y5B0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CTDP1Q9Y5B0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CTDP1Q9Y5B0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms