Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SORCS3Q9UPU3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SORCS3Q9UPU3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SORCS3Q9UPU3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SORCS3Q9UPU3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SORCS3Q9UPU3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SORCS3Q9UPU3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SORCS3Q9UPU3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SORCS3Q9UPU3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SORCS3Q9UPU3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SORCS3Q9UPU3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SORCS3Q9UPU3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SORCS3Q9UPU3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SORCS3Q9UPU3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SORCS3Q9UPU3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SORCS3Q9UPU3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SORCS3Q9UPU3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SORCS3Q9UPU3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SORCS3Q9UPU3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SORCS3Q9UPU3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SORCS3Q9UPU3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SORCS3Q9UPU3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SORCS3Q9UPU3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SORCS3Q9UPU3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SORCS3Q9UPU3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SORCS3Q9UPU3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SORCS3Q9UPU3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SORCS3Q9UPU3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SORCS3Q9UPU3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SORCS3Q9UPU3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SORCS3Q9UPU3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SORCS3Q9UPU3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SORCS3Q9UPU3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SORCS3Q9UPU3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SORCS3Q9UPU3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SORCS3Q9UPU3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SORCS3Q9UPU3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SORCS3Q9UPU3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SORCS3Q9UPU3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SORCS3Q9UPU3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SORCS3Q9UPU3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SORCS3Q9UPU3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SORCS3Q9UPU3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SORCS3Q9UPU3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SORCS3Q9UPU3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SORCS3Q9UPU3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SORCS3Q9UPU3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SORCS3Q9UPU3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SORCS3Q9UPU3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SORCS3Q9UPU3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SORCS3Q9UPU3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SORCS3Q9UPU3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SORCS3Q9UPU3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SORCS3Q9UPU3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SORCS3Q9UPU3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SORCS3Q9UPU3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SORCS3Q9UPU3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SORCS3Q9UPU3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SORCS3Q9UPU3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SORCS3Q9UPU3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SORCS3Q9UPU3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SORCS3Q9UPU3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SORCS3Q9UPU3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SORCS3Q9UPU3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SORCS3Q9UPU3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SORCS3Q9UPU3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SORCS3Q9UPU3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SORCS3Q9UPU3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SORCS3Q9UPU3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SORCS3Q9UPU3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SORCS3Q9UPU3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SORCS3Q9UPU3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SORCS3Q9UPU3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SORCS3Q9UPU3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SORCS3Q9UPU3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SORCS3Q9UPU3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SORCS3Q9UPU3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SORCS3Q9UPU3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SORCS3Q9UPU3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SORCS3Q9UPU3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SORCS3Q9UPU3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SORCS3Q9UPU3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SORCS3Q9UPU3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SORCS3Q9UPU3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SORCS3Q9UPU3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SORCS3Q9UPU3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SORCS3Q9UPU3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SORCS3Q9UPU3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SORCS3Q9UPU3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SORCS3Q9UPU3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SORCS3Q9UPU3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SORCS3Q9UPU3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SORCS3Q9UPU3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SORCS3Q9UPU3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SORCS3Q9UPU3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SORCS3Q9UPU3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SORCS3Q9UPU3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SORCS3Q9UPU3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SORCS3Q9UPU3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SORCS3Q9UPU3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms