Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FZD4Q9ULV1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FZD4Q9ULV1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FZD4Q9ULV1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FZD4Q9ULV1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FZD4Q9ULV1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FZD4Q9ULV1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FZD4Q9ULV1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FZD4Q9ULV1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FZD4Q9ULV1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FZD4Q9ULV1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FZD4Q9ULV1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FZD4Q9ULV1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FZD4Q9ULV1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FZD4Q9ULV1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FZD4Q9ULV1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FZD4Q9ULV1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FZD4Q9ULV1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FZD4Q9ULV1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FZD4Q9ULV1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FZD4Q9ULV1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FZD4Q9ULV1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FZD4Q9ULV1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FZD4Q9ULV1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FZD4Q9ULV1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FZD4Q9ULV1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FZD4Q9ULV1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FZD4Q9ULV1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FZD4Q9ULV1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FZD4Q9ULV1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FZD4Q9ULV1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FZD4Q9ULV1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FZD4Q9ULV1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FZD4Q9ULV1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FZD4Q9ULV1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FZD4Q9ULV1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FZD4Q9ULV1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FZD4Q9ULV1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FZD4Q9ULV1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FZD4Q9ULV1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FZD4Q9ULV1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FZD4Q9ULV1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FZD4Q9ULV1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FZD4Q9ULV1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FZD4Q9ULV1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FZD4Q9ULV1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FZD4Q9ULV1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FZD4Q9ULV1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FZD4Q9ULV1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FZD4Q9ULV1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FZD4Q9ULV1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FZD4Q9ULV1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FZD4Q9ULV1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FZD4Q9ULV1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FZD4Q9ULV1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FZD4Q9ULV1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FZD4Q9ULV1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FZD4Q9ULV1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FZD4Q9ULV1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FZD4Q9ULV1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FZD4Q9ULV1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FZD4Q9ULV1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FZD4Q9ULV1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FZD4Q9ULV1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FZD4Q9ULV1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FZD4Q9ULV1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FZD4Q9ULV1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FZD4Q9ULV1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FZD4Q9ULV1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FZD4Q9ULV1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FZD4Q9ULV1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FZD4Q9ULV1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FZD4Q9ULV1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FZD4Q9ULV1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FZD4Q9ULV1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FZD4Q9ULV1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FZD4Q9ULV1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FZD4Q9ULV1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FZD4Q9ULV1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FZD4Q9ULV1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FZD4Q9ULV1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FZD4Q9ULV1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FZD4Q9ULV1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FZD4Q9ULV1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FZD4Q9ULV1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FZD4Q9ULV1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FZD4Q9ULV1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FZD4Q9ULV1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FZD4Q9ULV1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FZD4Q9ULV1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FZD4Q9ULV1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FZD4Q9ULV1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FZD4Q9ULV1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FZD4Q9ULV1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
FZD4Q9ULV1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FZD4Q9ULV1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FZD4Q9ULV1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FZD4Q9ULV1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FZD4Q9ULV1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FZD4Q9ULV1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms