Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms