Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRID1Q9ULK0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRID1Q9ULK0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRID1Q9ULK0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRID1Q9ULK0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRID1Q9ULK0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRID1Q9ULK0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRID1Q9ULK0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRID1Q9ULK0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRID1Q9ULK0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRID1Q9ULK0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRID1Q9ULK0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRID1Q9ULK0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRID1Q9ULK0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRID1Q9ULK0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GRID1Q9ULK0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRID1Q9ULK0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GRID1Q9ULK0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRID1Q9ULK0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRID1Q9ULK0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRID1Q9ULK0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRID1Q9ULK0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRID1Q9ULK0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRID1Q9ULK0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRID1Q9ULK0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRID1Q9ULK0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRID1Q9ULK0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRID1Q9ULK0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRID1Q9ULK0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRID1Q9ULK0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRID1Q9ULK0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRID1Q9ULK0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRID1Q9ULK0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRID1Q9ULK0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRID1Q9ULK0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRID1Q9ULK0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRID1Q9ULK0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRID1Q9ULK0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRID1Q9ULK0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRID1Q9ULK0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRID1Q9ULK0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRID1Q9ULK0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GRID1Q9ULK0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GRID1Q9ULK0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRID1Q9ULK0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRID1Q9ULK0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRID1Q9ULK0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRID1Q9ULK0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRID1Q9ULK0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRID1Q9ULK0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRID1Q9ULK0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRID1Q9ULK0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRID1Q9ULK0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRID1Q9ULK0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRID1Q9ULK0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GRID1Q9ULK0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRID1Q9ULK0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRID1Q9ULK0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRID1Q9ULK0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRID1Q9ULK0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRID1Q9ULK0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRID1Q9ULK0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRID1Q9ULK0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRID1Q9ULK0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRID1Q9ULK0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRID1Q9ULK0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRID1Q9ULK0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRID1Q9ULK0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRID1Q9ULK0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRID1Q9ULK0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRID1Q9ULK0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRID1Q9ULK0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRID1Q9ULK0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRID1Q9ULK0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRID1Q9ULK0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRID1Q9ULK0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRID1Q9ULK0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRID1Q9ULK0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRID1Q9ULK0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRID1Q9ULK0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRID1Q9ULK0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRID1Q9ULK0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRID1Q9ULK0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRID1Q9ULK0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRID1Q9ULK0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRID1Q9ULK0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRID1Q9ULK0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRID1Q9ULK0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GRID1Q9ULK0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRID1Q9ULK0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRID1Q9ULK0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRID1Q9ULK0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRID1Q9ULK0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRID1Q9ULK0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRID1Q9ULK0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GRID1Q9ULK0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GRID1Q9ULK0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRID1Q9ULK0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRID1Q9ULK0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRID1Q9ULK0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms