Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSFQ9UBX1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSFQ9UBX1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSFQ9UBX1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSFQ9UBX1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSFQ9UBX1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTSFQ9UBX1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTSFQ9UBX1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTSFQ9UBX1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTSFQ9UBX1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTSFQ9UBX1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSFQ9UBX1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSFQ9UBX1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSFQ9UBX1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSFQ9UBX1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSFQ9UBX1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSFQ9UBX1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSFQ9UBX1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSFQ9UBX1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSFQ9UBX1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSFQ9UBX1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSFQ9UBX1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSFQ9UBX1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSFQ9UBX1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CTSFQ9UBX1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CTSFQ9UBX1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSFQ9UBX1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSFQ9UBX1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSFQ9UBX1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSFQ9UBX1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSFQ9UBX1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSFQ9UBX1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSFQ9UBX1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSFQ9UBX1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSFQ9UBX1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSFQ9UBX1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSFQ9UBX1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSFQ9UBX1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSFQ9UBX1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTSFQ9UBX1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTSFQ9UBX1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTSFQ9UBX1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTSFQ9UBX1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTSFQ9UBX1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTSFQ9UBX1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTSFQ9UBX1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTSFQ9UBX1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTSFQ9UBX1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTSFQ9UBX1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTSFQ9UBX1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTSFQ9UBX1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTSFQ9UBX1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTSFQ9UBX1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTSFQ9UBX1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTSFQ9UBX1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTSFQ9UBX1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CTSFQ9UBX1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTSFQ9UBX1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTSFQ9UBX1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTSFQ9UBX1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTSFQ9UBX1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTSFQ9UBX1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTSFQ9UBX1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTSFQ9UBX1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTSFQ9UBX1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTSFQ9UBX1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CTSFQ9UBX1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTSFQ9UBX1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CTSFQ9UBX1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTSFQ9UBX1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTSFQ9UBX1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTSFQ9UBX1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTSFQ9UBX1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTSFQ9UBX1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTSFQ9UBX1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTSFQ9UBX1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTSFQ9UBX1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTSFQ9UBX1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTSFQ9UBX1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTSFQ9UBX1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTSFQ9UBX1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTSFQ9UBX1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTSFQ9UBX1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTSFQ9UBX1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTSFQ9UBX1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTSFQ9UBX1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTSFQ9UBX1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTSFQ9UBX1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTSFQ9UBX1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CTSFQ9UBX1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTSFQ9UBX1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms