Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COMMD8Q9NX08 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COMMD8Q9NX08 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COMMD8Q9NX08 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COMMD8Q9NX08 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COMMD8Q9NX08 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COMMD8Q9NX08 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COMMD8Q9NX08 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COMMD8Q9NX08 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COMMD8Q9NX08 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COMMD8Q9NX08 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COMMD8Q9NX08 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
COMMD8Q9NX08 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
COMMD8Q9NX08 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COMMD8Q9NX08 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COMMD8Q9NX08 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COMMD8Q9NX08 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COMMD8Q9NX08 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COMMD8Q9NX08 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COMMD8Q9NX08 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COMMD8Q9NX08 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COMMD8Q9NX08 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COMMD8Q9NX08 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COMMD8Q9NX08 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COMMD8Q9NX08 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COMMD8Q9NX08 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COMMD8Q9NX08 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COMMD8Q9NX08 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
COMMD8Q9NX08 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
COMMD8Q9NX08 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
COMMD8Q9NX08 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COMMD8Q9NX08 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COMMD8Q9NX08 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COMMD8Q9NX08 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COMMD8Q9NX08 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COMMD8Q9NX08 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COMMD8Q9NX08 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COMMD8Q9NX08 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COMMD8Q9NX08 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COMMD8Q9NX08 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COMMD8Q9NX08 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COMMD8Q9NX08 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COMMD8Q9NX08 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COMMD8Q9NX08 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COMMD8Q9NX08 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COMMD8Q9NX08 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
COMMD8Q9NX08 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COMMD8Q9NX08 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COMMD8Q9NX08 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
COMMD8Q9NX08 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COMMD8Q9NX08 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COMMD8Q9NX08 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COMMD8Q9NX08 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COMMD8Q9NX08 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COMMD8Q9NX08 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COMMD8Q9NX08 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COMMD8Q9NX08 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COMMD8Q9NX08 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COMMD8Q9NX08 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COMMD8Q9NX08 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COMMD8Q9NX08 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COMMD8Q9NX08 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COMMD8Q9NX08 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
COMMD8Q9NX08 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COMMD8Q9NX08 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
COMMD8Q9NX08 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COMMD8Q9NX08 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COMMD8Q9NX08 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COMMD8Q9NX08 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COMMD8Q9NX08 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
COMMD8Q9NX08 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COMMD8Q9NX08 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
COMMD8Q9NX08 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COMMD8Q9NX08 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COMMD8Q9NX08 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COMMD8Q9NX08 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COMMD8Q9NX08 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COMMD8Q9NX08 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COMMD8Q9NX08 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COMMD8Q9NX08 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COMMD8Q9NX08 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COMMD8Q9NX08 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COMMD8Q9NX08 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COMMD8Q9NX08 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COMMD8Q9NX08 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COMMD8Q9NX08 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COMMD8Q9NX08 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COMMD8Q9NX08 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COMMD8Q9NX08 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COMMD8Q9NX08 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COMMD8Q9NX08 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COMMD8Q9NX08 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COMMD8Q9NX08 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COMMD8Q9NX08 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COMMD8Q9NX08 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COMMD8Q9NX08 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COMMD8Q9NX08 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COMMD8Q9NX08 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COMMD8Q9NX08 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COMMD8Q9NX08 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
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