Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH6

TMLHE, Trimethyllysine dioxygenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMLHEQ9NVH6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMLHEQ9NVH6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMLHEQ9NVH6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMLHEQ9NVH6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMLHEQ9NVH6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMLHEQ9NVH6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMLHEQ9NVH6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMLHEQ9NVH6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMLHEQ9NVH6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMLHEQ9NVH6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMLHEQ9NVH6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMLHEQ9NVH6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMLHEQ9NVH6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMLHEQ9NVH6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMLHEQ9NVH6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMLHEQ9NVH6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TMLHEQ9NVH6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMLHEQ9NVH6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMLHEQ9NVH6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMLHEQ9NVH6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMLHEQ9NVH6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TMLHEQ9NVH6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TMLHEQ9NVH6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMLHEQ9NVH6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TMLHEQ9NVH6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMLHEQ9NVH6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMLHEQ9NVH6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMLHEQ9NVH6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMLHEQ9NVH6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMLHEQ9NVH6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMLHEQ9NVH6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMLHEQ9NVH6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMLHEQ9NVH6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMLHEQ9NVH6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMLHEQ9NVH6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMLHEQ9NVH6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMLHEQ9NVH6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMLHEQ9NVH6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMLHEQ9NVH6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMLHEQ9NVH6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMLHEQ9NVH6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMLHEQ9NVH6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TMLHEQ9NVH6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMLHEQ9NVH6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMLHEQ9NVH6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMLHEQ9NVH6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMLHEQ9NVH6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMLHEQ9NVH6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMLHEQ9NVH6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMLHEQ9NVH6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMLHEQ9NVH6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMLHEQ9NVH6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMLHEQ9NVH6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMLHEQ9NVH6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMLHEQ9NVH6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMLHEQ9NVH6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMLHEQ9NVH6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMLHEQ9NVH6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMLHEQ9NVH6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMLHEQ9NVH6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMLHEQ9NVH6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMLHEQ9NVH6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMLHEQ9NVH6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TMLHEQ9NVH6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMLHEQ9NVH6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMLHEQ9NVH6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMLHEQ9NVH6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMLHEQ9NVH6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMLHEQ9NVH6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMLHEQ9NVH6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMLHEQ9NVH6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TMLHEQ9NVH6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMLHEQ9NVH6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TMLHEQ9NVH6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMLHEQ9NVH6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMLHEQ9NVH6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMLHEQ9NVH6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMLHEQ9NVH6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMLHEQ9NVH6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMLHEQ9NVH6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMLHEQ9NVH6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMLHEQ9NVH6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMLHEQ9NVH6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMLHEQ9NVH6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMLHEQ9NVH6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMLHEQ9NVH6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMLHEQ9NVH6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMLHEQ9NVH6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMLHEQ9NVH6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMLHEQ9NVH6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMLHEQ9NVH6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TMLHEQ9NVH6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMLHEQ9NVH6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TMLHEQ9NVH6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMLHEQ9NVH6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMLHEQ9NVH6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMLHEQ9NVH6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMLHEQ9NVH6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMLHEQ9NVH6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMLHEQ9NVH6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
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