Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW7

XPNPEP1, Xaa-Pro aminopeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP1Q9NQW7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
XPNPEP1Q9NQW7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
XPNPEP1Q9NQW7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
XPNPEP1Q9NQW7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
XPNPEP1Q9NQW7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
XPNPEP1Q9NQW7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
XPNPEP1Q9NQW7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
XPNPEP1Q9NQW7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
XPNPEP1Q9NQW7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
XPNPEP1Q9NQW7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
XPNPEP1Q9NQW7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
XPNPEP1Q9NQW7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
XPNPEP1Q9NQW7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
XPNPEP1Q9NQW7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
XPNPEP1Q9NQW7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
XPNPEP1Q9NQW7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
XPNPEP1Q9NQW7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
XPNPEP1Q9NQW7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
XPNPEP1Q9NQW7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
XPNPEP1Q9NQW7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
XPNPEP1Q9NQW7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
XPNPEP1Q9NQW7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
XPNPEP1Q9NQW7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
XPNPEP1Q9NQW7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
XPNPEP1Q9NQW7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
XPNPEP1Q9NQW7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
XPNPEP1Q9NQW7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
XPNPEP1Q9NQW7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
XPNPEP1Q9NQW7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
XPNPEP1Q9NQW7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
XPNPEP1Q9NQW7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
XPNPEP1Q9NQW7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
XPNPEP1Q9NQW7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
XPNPEP1Q9NQW7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
XPNPEP1Q9NQW7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
XPNPEP1Q9NQW7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
XPNPEP1Q9NQW7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
XPNPEP1Q9NQW7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
XPNPEP1Q9NQW7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
XPNPEP1Q9NQW7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
XPNPEP1Q9NQW7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
XPNPEP1Q9NQW7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
XPNPEP1Q9NQW7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
XPNPEP1Q9NQW7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
XPNPEP1Q9NQW7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
XPNPEP1Q9NQW7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
XPNPEP1Q9NQW7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
XPNPEP1Q9NQW7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
XPNPEP1Q9NQW7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
XPNPEP1Q9NQW7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
XPNPEP1Q9NQW7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
XPNPEP1Q9NQW7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
XPNPEP1Q9NQW7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
XPNPEP1Q9NQW7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
XPNPEP1Q9NQW7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
XPNPEP1Q9NQW7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
XPNPEP1Q9NQW7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
XPNPEP1Q9NQW7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
XPNPEP1Q9NQW7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
XPNPEP1Q9NQW7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
XPNPEP1Q9NQW7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
XPNPEP1Q9NQW7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
XPNPEP1Q9NQW7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
XPNPEP1Q9NQW7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
XPNPEP1Q9NQW7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
XPNPEP1Q9NQW7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
XPNPEP1Q9NQW7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
XPNPEP1Q9NQW7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
XPNPEP1Q9NQW7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
XPNPEP1Q9NQW7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
XPNPEP1Q9NQW7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
XPNPEP1Q9NQW7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
XPNPEP1Q9NQW7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
XPNPEP1Q9NQW7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
XPNPEP1Q9NQW7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
XPNPEP1Q9NQW7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
XPNPEP1Q9NQW7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
XPNPEP1Q9NQW7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
XPNPEP1Q9NQW7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
XPNPEP1Q9NQW7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
XPNPEP1Q9NQW7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
XPNPEP1Q9NQW7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
XPNPEP1Q9NQW7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
XPNPEP1Q9NQW7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
XPNPEP1Q9NQW7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
XPNPEP1Q9NQW7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
XPNPEP1Q9NQW7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
XPNPEP1Q9NQW7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
XPNPEP1Q9NQW7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
XPNPEP1Q9NQW7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
XPNPEP1Q9NQW7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
XPNPEP1Q9NQW7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
XPNPEP1Q9NQW7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
XPNPEP1Q9NQW7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
XPNPEP1Q9NQW7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
XPNPEP1Q9NQW7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
XPNPEP1Q9NQW7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
XPNPEP1Q9NQW7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
XPNPEP1Q9NQW7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
XPNPEP1Q9NQW7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms