Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ6

CHRNA10, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA10Q9GZZ6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA10Q9GZZ6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA10Q9GZZ6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA10Q9GZZ6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA10Q9GZZ6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA10Q9GZZ6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNA10Q9GZZ6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA10Q9GZZ6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA10Q9GZZ6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA10Q9GZZ6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA10Q9GZZ6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA10Q9GZZ6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA10Q9GZZ6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA10Q9GZZ6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA10Q9GZZ6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA10Q9GZZ6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA10Q9GZZ6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA10Q9GZZ6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA10Q9GZZ6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA10Q9GZZ6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA10Q9GZZ6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA10Q9GZZ6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA10Q9GZZ6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA10Q9GZZ6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA10Q9GZZ6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA10Q9GZZ6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA10Q9GZZ6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA10Q9GZZ6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA10Q9GZZ6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA10Q9GZZ6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA10Q9GZZ6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA10Q9GZZ6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA10Q9GZZ6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA10Q9GZZ6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA10Q9GZZ6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA10Q9GZZ6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA10Q9GZZ6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA10Q9GZZ6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA10Q9GZZ6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA10Q9GZZ6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA10Q9GZZ6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA10Q9GZZ6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA10Q9GZZ6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA10Q9GZZ6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA10Q9GZZ6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA10Q9GZZ6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA10Q9GZZ6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA10Q9GZZ6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA10Q9GZZ6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA10Q9GZZ6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA10Q9GZZ6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHRNA10Q9GZZ6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA10Q9GZZ6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA10Q9GZZ6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA10Q9GZZ6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA10Q9GZZ6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA10Q9GZZ6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA10Q9GZZ6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA10Q9GZZ6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA10Q9GZZ6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA10Q9GZZ6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA10Q9GZZ6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA10Q9GZZ6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA10Q9GZZ6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA10Q9GZZ6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA10Q9GZZ6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA10Q9GZZ6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA10Q9GZZ6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA10Q9GZZ6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA10Q9GZZ6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA10Q9GZZ6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA10Q9GZZ6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA10Q9GZZ6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA10Q9GZZ6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA10Q9GZZ6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA10Q9GZZ6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA10Q9GZZ6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA10Q9GZZ6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA10Q9GZZ6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA10Q9GZZ6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHRNA10Q9GZZ6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA10Q9GZZ6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA10Q9GZZ6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA10Q9GZZ6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA10Q9GZZ6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA10Q9GZZ6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA10Q9GZZ6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA10Q9GZZ6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA10Q9GZZ6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA10Q9GZZ6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA10Q9GZZ6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA10Q9GZZ6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA10Q9GZZ6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA10Q9GZZ6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA10Q9GZZ6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA10Q9GZZ6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA10Q9GZZ6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA10Q9GZZ6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA10Q9GZZ6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA10Q9GZZ6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms