Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0G0

ZNF407, Zinc finger protein 407, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF407Q9C0G0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF407Q9C0G0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF407Q9C0G0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF407Q9C0G0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF407Q9C0G0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF407Q9C0G0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF407Q9C0G0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.02■■□□□ 1.27
ZNF407Q9C0G0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF407Q9C0G0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF407Q9C0G0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF407Q9C0G0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF407Q9C0G0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF407Q9C0G0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF407Q9C0G0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF407Q9C0G0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNF407Q9C0G0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF407Q9C0G0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF407Q9C0G0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF407Q9C0G0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF407Q9C0G0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF407Q9C0G0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF407Q9C0G0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF407Q9C0G0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF407Q9C0G0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF407Q9C0G0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF407Q9C0G0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF407Q9C0G0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF407Q9C0G0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF407Q9C0G0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF407Q9C0G0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF407Q9C0G0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF407Q9C0G0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF407Q9C0G0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF407Q9C0G0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF407Q9C0G0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF407Q9C0G0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF407Q9C0G0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ZNF407Q9C0G0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF407Q9C0G0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF407Q9C0G0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF407Q9C0G0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF407Q9C0G0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF407Q9C0G0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF407Q9C0G0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF407Q9C0G0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF407Q9C0G0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF407Q9C0G0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF407Q9C0G0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF407Q9C0G0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF407Q9C0G0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF407Q9C0G0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF407Q9C0G0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF407Q9C0G0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF407Q9C0G0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF407Q9C0G0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF407Q9C0G0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF407Q9C0G0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF407Q9C0G0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF407Q9C0G0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF407Q9C0G0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF407Q9C0G0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF407Q9C0G0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF407Q9C0G0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF407Q9C0G0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF407Q9C0G0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF407Q9C0G0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF407Q9C0G0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF407Q9C0G0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF407Q9C0G0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF407Q9C0G0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF407Q9C0G0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF407Q9C0G0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF407Q9C0G0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF407Q9C0G0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF407Q9C0G0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF407Q9C0G0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF407Q9C0G0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF407Q9C0G0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF407Q9C0G0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF407Q9C0G0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF407Q9C0G0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF407Q9C0G0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF407Q9C0G0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF407Q9C0G0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF407Q9C0G0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF407Q9C0G0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF407Q9C0G0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF407Q9C0G0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF407Q9C0G0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF407Q9C0G0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF407Q9C0G0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF407Q9C0G0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF407Q9C0G0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF407Q9C0G0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF407Q9C0G0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF407Q9C0G0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF407Q9C0G0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF407Q9C0G0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF407Q9C0G0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF407Q9C0G0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms