Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM5Q9C035 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM5Q9C035 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM5Q9C035 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM5Q9C035 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM5Q9C035 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM5Q9C035 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM5Q9C035 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM5Q9C035 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM5Q9C035 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM5Q9C035 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM5Q9C035 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM5Q9C035 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM5Q9C035 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM5Q9C035 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM5Q9C035 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM5Q9C035 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM5Q9C035 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM5Q9C035 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM5Q9C035 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM5Q9C035 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM5Q9C035 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM5Q9C035 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM5Q9C035 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM5Q9C035 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM5Q9C035 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM5Q9C035 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM5Q9C035 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM5Q9C035 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM5Q9C035 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM5Q9C035 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM5Q9C035 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM5Q9C035 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM5Q9C035 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM5Q9C035 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM5Q9C035 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM5Q9C035 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM5Q9C035 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM5Q9C035 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM5Q9C035 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM5Q9C035 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM5Q9C035 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM5Q9C035 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM5Q9C035 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM5Q9C035 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM5Q9C035 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM5Q9C035 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM5Q9C035 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM5Q9C035 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM5Q9C035 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM5Q9C035 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM5Q9C035 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM5Q9C035 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM5Q9C035 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM5Q9C035 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM5Q9C035 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM5Q9C035 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM5Q9C035 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM5Q9C035 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM5Q9C035 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM5Q9C035 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM5Q9C035 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM5Q9C035 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM5Q9C035 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM5Q9C035 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM5Q9C035 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM5Q9C035 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM5Q9C035 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM5Q9C035 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM5Q9C035 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM5Q9C035 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM5Q9C035 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM5Q9C035 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM5Q9C035 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM5Q9C035 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM5Q9C035 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM5Q9C035 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM5Q9C035 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM5Q9C035 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM5Q9C035 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM5Q9C035 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM5Q9C035 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM5Q9C035 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM5Q9C035 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM5Q9C035 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM5Q9C035 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM5Q9C035 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM5Q9C035 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM5Q9C035 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM5Q9C035 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM5Q9C035 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM5Q9C035 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM5Q9C035 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM5Q9C035 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM5Q9C035 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM5Q9C035 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM5Q9C035 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM5Q9C035 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM5Q9C035 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM5Q9C035 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms