Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC106Q9BWC9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC106Q9BWC9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC106Q9BWC9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC106Q9BWC9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC106Q9BWC9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC106Q9BWC9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC106Q9BWC9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC106Q9BWC9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC106Q9BWC9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC106Q9BWC9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC106Q9BWC9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC106Q9BWC9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC106Q9BWC9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC106Q9BWC9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC106Q9BWC9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC106Q9BWC9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC106Q9BWC9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC106Q9BWC9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC106Q9BWC9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC106Q9BWC9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC106Q9BWC9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC106Q9BWC9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC106Q9BWC9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC106Q9BWC9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC106Q9BWC9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC106Q9BWC9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC106Q9BWC9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC106Q9BWC9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC106Q9BWC9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC106Q9BWC9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC106Q9BWC9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC106Q9BWC9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC106Q9BWC9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC106Q9BWC9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC106Q9BWC9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC106Q9BWC9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC106Q9BWC9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC106Q9BWC9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC106Q9BWC9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC106Q9BWC9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC106Q9BWC9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC106Q9BWC9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC106Q9BWC9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC106Q9BWC9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC106Q9BWC9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC106Q9BWC9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC106Q9BWC9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC106Q9BWC9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC106Q9BWC9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC106Q9BWC9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC106Q9BWC9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC106Q9BWC9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC106Q9BWC9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC106Q9BWC9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC106Q9BWC9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC106Q9BWC9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC106Q9BWC9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC106Q9BWC9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC106Q9BWC9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC106Q9BWC9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC106Q9BWC9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC106Q9BWC9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC106Q9BWC9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC106Q9BWC9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC106Q9BWC9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC106Q9BWC9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC106Q9BWC9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC106Q9BWC9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC106Q9BWC9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC106Q9BWC9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC106Q9BWC9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC106Q9BWC9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC106Q9BWC9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC106Q9BWC9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC106Q9BWC9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC106Q9BWC9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC106Q9BWC9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC106Q9BWC9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC106Q9BWC9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC106Q9BWC9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC106Q9BWC9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC106Q9BWC9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC106Q9BWC9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC106Q9BWC9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC106Q9BWC9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC106Q9BWC9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC106Q9BWC9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC106Q9BWC9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC106Q9BWC9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC106Q9BWC9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC106Q9BWC9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC106Q9BWC9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC106Q9BWC9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC106Q9BWC9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC106Q9BWC9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC106Q9BWC9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC106Q9BWC9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC106Q9BWC9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC106Q9BWC9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms