Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC94Q9BW85 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC94Q9BW85 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC94Q9BW85 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC94Q9BW85 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC94Q9BW85 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC94Q9BW85 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC94Q9BW85 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC94Q9BW85 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC94Q9BW85 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC94Q9BW85 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC94Q9BW85 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC94Q9BW85 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC94Q9BW85 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC94Q9BW85 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC94Q9BW85 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC94Q9BW85 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC94Q9BW85 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC94Q9BW85 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC94Q9BW85 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC94Q9BW85 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC94Q9BW85 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC94Q9BW85 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CCDC94Q9BW85 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC94Q9BW85 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC94Q9BW85 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC94Q9BW85 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC94Q9BW85 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC94Q9BW85 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC94Q9BW85 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC94Q9BW85 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC94Q9BW85 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC94Q9BW85 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC94Q9BW85 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC94Q9BW85 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC94Q9BW85 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC94Q9BW85 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC94Q9BW85 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC94Q9BW85 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC94Q9BW85 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC94Q9BW85 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC94Q9BW85 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC94Q9BW85 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC94Q9BW85 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC94Q9BW85 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC94Q9BW85 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC94Q9BW85 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC94Q9BW85 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CCDC94Q9BW85 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC94Q9BW85 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC94Q9BW85 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC94Q9BW85 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC94Q9BW85 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC94Q9BW85 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC94Q9BW85 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC94Q9BW85 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC94Q9BW85 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC94Q9BW85 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC94Q9BW85 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC94Q9BW85 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC94Q9BW85 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC94Q9BW85 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC94Q9BW85 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC94Q9BW85 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC94Q9BW85 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC94Q9BW85 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC94Q9BW85 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC94Q9BW85 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC94Q9BW85 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC94Q9BW85 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC94Q9BW85 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC94Q9BW85 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC94Q9BW85 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC94Q9BW85 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC94Q9BW85 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC94Q9BW85 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC94Q9BW85 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC94Q9BW85 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms