Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
FYCO1Q9BQS8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
FYCO1Q9BQS8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
FYCO1Q9BQS8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
FYCO1Q9BQS8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
FYCO1Q9BQS8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
FYCO1Q9BQS8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
FYCO1Q9BQS8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
FYCO1Q9BQS8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
FYCO1Q9BQS8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
FYCO1Q9BQS8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
FYCO1Q9BQS8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.03
FYCO1Q9BQS8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC40.19■■■■■ 4.03
FYCO1Q9BQS8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
FYCO1Q9BQS8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC40.18■■■■■ 4.02
FYCO1Q9BQS8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
FYCO1Q9BQS8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
FYCO1Q9BQS8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
FYCO1Q9BQS8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
FYCO1Q9BQS8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
FYCO1Q9BQS8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
FYCO1Q9BQS8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
FYCO1Q9BQS8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
FYCO1Q9BQS8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
FYCO1Q9BQS8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
FYCO1Q9BQS8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC40.13■■■■■ 4.02
FYCO1Q9BQS8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
FYCO1Q9BQS8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
FYCO1Q9BQS8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
FYCO1Q9BQS8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
FYCO1Q9BQS8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
FYCO1Q9BQS8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
FYCO1Q9BQS8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
FYCO1Q9BQS8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
FYCO1Q9BQS8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
FYCO1Q9BQS8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
FYCO1Q9BQS8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
FYCO1Q9BQS8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
FYCO1Q9BQS8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC40.05■■■■■ 4
FYCO1Q9BQS8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
FYCO1Q9BQS8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
FYCO1Q9BQS8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
FYCO1Q9BQS8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
FYCO1Q9BQS8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
FYCO1Q9BQS8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
FYCO1Q9BQS8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC40.02■■■■■ 4
FYCO1Q9BQS8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
FYCO1Q9BQS8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
FYCO1Q9BQS8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
FYCO1Q9BQS8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
FYCO1Q9BQS8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
FYCO1Q9BQS8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
FYCO1Q9BQS8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
FYCO1Q9BQS8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
FYCO1Q9BQS8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
FYCO1Q9BQS8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC39.98■■■■□ 3.99
FYCO1Q9BQS8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
FYCO1Q9BQS8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
FYCO1Q9BQS8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
FYCO1Q9BQS8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
FYCO1Q9BQS8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
FYCO1Q9BQS8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
FYCO1Q9BQS8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
FYCO1Q9BQS8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
FYCO1Q9BQS8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
FYCO1Q9BQS8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
FYCO1Q9BQS8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
FYCO1Q9BQS8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
FYCO1Q9BQS8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
FYCO1Q9BQS8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
FYCO1Q9BQS8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
FYCO1Q9BQS8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
FYCO1Q9BQS8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
FYCO1Q9BQS8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
FYCO1Q9BQS8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC39.93■■■■□ 3.98
FYCO1Q9BQS8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
FYCO1Q9BQS8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
FYCO1Q9BQS8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC39.91■■■■□ 3.98
FYCO1Q9BQS8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
FYCO1Q9BQS8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
FYCO1Q9BQS8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
FYCO1Q9BQS8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
FYCO1Q9BQS8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
FYCO1Q9BQS8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
FYCO1Q9BQS8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
FYCO1Q9BQS8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
FYCO1Q9BQS8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
FYCO1Q9BQS8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC39.88■■■■□ 3.98
FYCO1Q9BQS8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
FYCO1Q9BQS8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
FYCO1Q9BQS8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC39.87■■■■□ 3.97
FYCO1Q9BQS8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
FYCO1Q9BQS8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
FYCO1Q9BQS8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC39.84■■■■□ 3.97
FYCO1Q9BQS8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC39.84■■■■□ 3.97
FYCO1Q9BQS8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
FYCO1Q9BQS8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
FYCO1Q9BQS8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
FYCO1Q9BQS8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
FYCO1Q9BQS8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC39.82■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms