Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQB6

VKORC1, Vitamin K epoxide reductase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VKORC1Q9BQB6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VKORC1Q9BQB6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VKORC1Q9BQB6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VKORC1Q9BQB6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VKORC1Q9BQB6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VKORC1Q9BQB6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VKORC1Q9BQB6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VKORC1Q9BQB6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VKORC1Q9BQB6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VKORC1Q9BQB6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VKORC1Q9BQB6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VKORC1Q9BQB6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VKORC1Q9BQB6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VKORC1Q9BQB6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VKORC1Q9BQB6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VKORC1Q9BQB6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VKORC1Q9BQB6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VKORC1Q9BQB6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VKORC1Q9BQB6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VKORC1Q9BQB6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VKORC1Q9BQB6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VKORC1Q9BQB6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VKORC1Q9BQB6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VKORC1Q9BQB6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VKORC1Q9BQB6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VKORC1Q9BQB6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VKORC1Q9BQB6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VKORC1Q9BQB6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VKORC1Q9BQB6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VKORC1Q9BQB6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VKORC1Q9BQB6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VKORC1Q9BQB6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VKORC1Q9BQB6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VKORC1Q9BQB6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VKORC1Q9BQB6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VKORC1Q9BQB6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VKORC1Q9BQB6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VKORC1Q9BQB6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VKORC1Q9BQB6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VKORC1Q9BQB6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VKORC1Q9BQB6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VKORC1Q9BQB6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VKORC1Q9BQB6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VKORC1Q9BQB6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VKORC1Q9BQB6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VKORC1Q9BQB6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VKORC1Q9BQB6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VKORC1Q9BQB6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VKORC1Q9BQB6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VKORC1Q9BQB6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VKORC1Q9BQB6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VKORC1Q9BQB6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VKORC1Q9BQB6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VKORC1Q9BQB6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VKORC1Q9BQB6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VKORC1Q9BQB6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VKORC1Q9BQB6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VKORC1Q9BQB6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VKORC1Q9BQB6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VKORC1Q9BQB6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VKORC1Q9BQB6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VKORC1Q9BQB6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VKORC1Q9BQB6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VKORC1Q9BQB6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VKORC1Q9BQB6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VKORC1Q9BQB6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VKORC1Q9BQB6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VKORC1Q9BQB6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VKORC1Q9BQB6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VKORC1Q9BQB6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VKORC1Q9BQB6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VKORC1Q9BQB6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VKORC1Q9BQB6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VKORC1Q9BQB6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VKORC1Q9BQB6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VKORC1Q9BQB6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VKORC1Q9BQB6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VKORC1Q9BQB6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VKORC1Q9BQB6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VKORC1Q9BQB6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VKORC1Q9BQB6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VKORC1Q9BQB6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VKORC1Q9BQB6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VKORC1Q9BQB6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VKORC1Q9BQB6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VKORC1Q9BQB6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VKORC1Q9BQB6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VKORC1Q9BQB6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VKORC1Q9BQB6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VKORC1Q9BQB6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VKORC1Q9BQB6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VKORC1Q9BQB6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VKORC1Q9BQB6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VKORC1Q9BQB6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VKORC1Q9BQB6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VKORC1Q9BQB6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VKORC1Q9BQB6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VKORC1Q9BQB6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VKORC1Q9BQB6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VKORC1Q9BQB6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms