Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USB1Q9BQ65 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USB1Q9BQ65 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USB1Q9BQ65 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USB1Q9BQ65 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USB1Q9BQ65 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USB1Q9BQ65 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USB1Q9BQ65 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USB1Q9BQ65 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USB1Q9BQ65 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USB1Q9BQ65 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USB1Q9BQ65 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USB1Q9BQ65 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USB1Q9BQ65 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USB1Q9BQ65 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USB1Q9BQ65 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USB1Q9BQ65 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USB1Q9BQ65 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USB1Q9BQ65 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USB1Q9BQ65 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USB1Q9BQ65 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USB1Q9BQ65 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USB1Q9BQ65 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USB1Q9BQ65 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USB1Q9BQ65 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USB1Q9BQ65 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USB1Q9BQ65 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USB1Q9BQ65 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USB1Q9BQ65 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USB1Q9BQ65 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USB1Q9BQ65 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USB1Q9BQ65 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USB1Q9BQ65 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USB1Q9BQ65 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USB1Q9BQ65 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USB1Q9BQ65 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USB1Q9BQ65 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USB1Q9BQ65 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USB1Q9BQ65 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USB1Q9BQ65 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USB1Q9BQ65 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USB1Q9BQ65 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USB1Q9BQ65 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USB1Q9BQ65 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USB1Q9BQ65 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USB1Q9BQ65 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USB1Q9BQ65 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USB1Q9BQ65 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USB1Q9BQ65 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USB1Q9BQ65 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USB1Q9BQ65 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USB1Q9BQ65 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USB1Q9BQ65 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USB1Q9BQ65 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USB1Q9BQ65 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USB1Q9BQ65 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USB1Q9BQ65 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USB1Q9BQ65 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USB1Q9BQ65 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USB1Q9BQ65 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USB1Q9BQ65 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USB1Q9BQ65 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USB1Q9BQ65 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USB1Q9BQ65 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USB1Q9BQ65 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USB1Q9BQ65 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USB1Q9BQ65 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USB1Q9BQ65 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USB1Q9BQ65 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USB1Q9BQ65 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USB1Q9BQ65 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USB1Q9BQ65 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USB1Q9BQ65 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USB1Q9BQ65 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USB1Q9BQ65 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USB1Q9BQ65 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USB1Q9BQ65 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
USB1Q9BQ65 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USB1Q9BQ65 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USB1Q9BQ65 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USB1Q9BQ65 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USB1Q9BQ65 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USB1Q9BQ65 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USB1Q9BQ65 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USB1Q9BQ65 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USB1Q9BQ65 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USB1Q9BQ65 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USB1Q9BQ65 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USB1Q9BQ65 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USB1Q9BQ65 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USB1Q9BQ65 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USB1Q9BQ65 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USB1Q9BQ65 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USB1Q9BQ65 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USB1Q9BQ65 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USB1Q9BQ65 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USB1Q9BQ65 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USB1Q9BQ65 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USB1Q9BQ65 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USB1Q9BQ65 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms