Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCLT1Q96NL6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCLT1Q96NL6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCLT1Q96NL6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCLT1Q96NL6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCLT1Q96NL6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCLT1Q96NL6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCLT1Q96NL6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCLT1Q96NL6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCLT1Q96NL6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCLT1Q96NL6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCLT1Q96NL6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCLT1Q96NL6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCLT1Q96NL6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCLT1Q96NL6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCLT1Q96NL6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCLT1Q96NL6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCLT1Q96NL6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCLT1Q96NL6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCLT1Q96NL6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCLT1Q96NL6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCLT1Q96NL6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCLT1Q96NL6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCLT1Q96NL6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCLT1Q96NL6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCLT1Q96NL6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCLT1Q96NL6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCLT1Q96NL6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCLT1Q96NL6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCLT1Q96NL6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCLT1Q96NL6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCLT1Q96NL6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCLT1Q96NL6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCLT1Q96NL6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCLT1Q96NL6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCLT1Q96NL6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCLT1Q96NL6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCLT1Q96NL6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCLT1Q96NL6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCLT1Q96NL6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCLT1Q96NL6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCLT1Q96NL6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCLT1Q96NL6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCLT1Q96NL6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCLT1Q96NL6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCLT1Q96NL6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCLT1Q96NL6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCLT1Q96NL6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCLT1Q96NL6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCLT1Q96NL6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCLT1Q96NL6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SCLT1Q96NL6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SCLT1Q96NL6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCLT1Q96NL6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCLT1Q96NL6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCLT1Q96NL6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCLT1Q96NL6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCLT1Q96NL6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCLT1Q96NL6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCLT1Q96NL6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCLT1Q96NL6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCLT1Q96NL6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCLT1Q96NL6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCLT1Q96NL6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCLT1Q96NL6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCLT1Q96NL6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCLT1Q96NL6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCLT1Q96NL6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCLT1Q96NL6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCLT1Q96NL6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCLT1Q96NL6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCLT1Q96NL6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCLT1Q96NL6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCLT1Q96NL6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCLT1Q96NL6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCLT1Q96NL6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SCLT1Q96NL6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SCLT1Q96NL6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SCLT1Q96NL6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SCLT1Q96NL6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCLT1Q96NL6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCLT1Q96NL6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SCLT1Q96NL6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCLT1Q96NL6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCLT1Q96NL6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCLT1Q96NL6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCLT1Q96NL6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCLT1Q96NL6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SCLT1Q96NL6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCLT1Q96NL6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCLT1Q96NL6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SCLT1Q96NL6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCLT1Q96NL6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCLT1Q96NL6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SCLT1Q96NL6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCLT1Q96NL6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCLT1Q96NL6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCLT1Q96NL6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SCLT1Q96NL6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCLT1Q96NL6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.8 ms