Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRELD1Q96HD1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRELD1Q96HD1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRELD1Q96HD1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRELD1Q96HD1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRELD1Q96HD1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRELD1Q96HD1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRELD1Q96HD1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRELD1Q96HD1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CRELD1Q96HD1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRELD1Q96HD1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRELD1Q96HD1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRELD1Q96HD1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CRELD1Q96HD1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRELD1Q96HD1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRELD1Q96HD1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRELD1Q96HD1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRELD1Q96HD1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRELD1Q96HD1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRELD1Q96HD1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRELD1Q96HD1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRELD1Q96HD1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRELD1Q96HD1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRELD1Q96HD1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRELD1Q96HD1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CRELD1Q96HD1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRELD1Q96HD1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRELD1Q96HD1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRELD1Q96HD1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRELD1Q96HD1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRELD1Q96HD1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRELD1Q96HD1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRELD1Q96HD1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRELD1Q96HD1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRELD1Q96HD1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRELD1Q96HD1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRELD1Q96HD1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRELD1Q96HD1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CRELD1Q96HD1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CRELD1Q96HD1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRELD1Q96HD1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRELD1Q96HD1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRELD1Q96HD1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CRELD1Q96HD1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRELD1Q96HD1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRELD1Q96HD1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRELD1Q96HD1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRELD1Q96HD1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRELD1Q96HD1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRELD1Q96HD1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRELD1Q96HD1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRELD1Q96HD1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRELD1Q96HD1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRELD1Q96HD1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRELD1Q96HD1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRELD1Q96HD1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRELD1Q96HD1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRELD1Q96HD1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRELD1Q96HD1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRELD1Q96HD1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRELD1Q96HD1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRELD1Q96HD1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRELD1Q96HD1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRELD1Q96HD1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRELD1Q96HD1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRELD1Q96HD1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRELD1Q96HD1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRELD1Q96HD1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRELD1Q96HD1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRELD1Q96HD1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRELD1Q96HD1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRELD1Q96HD1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRELD1Q96HD1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRELD1Q96HD1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRELD1Q96HD1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CRELD1Q96HD1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRELD1Q96HD1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRELD1Q96HD1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRELD1Q96HD1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRELD1Q96HD1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRELD1Q96HD1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRELD1Q96HD1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRELD1Q96HD1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRELD1Q96HD1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRELD1Q96HD1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRELD1Q96HD1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CRELD1Q96HD1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRELD1Q96HD1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRELD1Q96HD1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRELD1Q96HD1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRELD1Q96HD1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRELD1Q96HD1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRELD1Q96HD1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CRELD1Q96HD1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRELD1Q96HD1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CRELD1Q96HD1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRELD1Q96HD1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRELD1Q96HD1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRELD1Q96HD1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRELD1Q96HD1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms