Protein–RNA interactions for Protein: Q96AX9

MIB2, E3 ubiquitin-protein ligase MIB2, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIB2Q96AX9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIB2Q96AX9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIB2Q96AX9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MIB2Q96AX9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MIB2Q96AX9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MIB2Q96AX9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MIB2Q96AX9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MIB2Q96AX9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MIB2Q96AX9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MIB2Q96AX9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MIB2Q96AX9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIB2Q96AX9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIB2Q96AX9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MIB2Q96AX9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIB2Q96AX9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIB2Q96AX9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIB2Q96AX9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIB2Q96AX9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIB2Q96AX9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIB2Q96AX9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIB2Q96AX9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIB2Q96AX9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIB2Q96AX9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIB2Q96AX9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIB2Q96AX9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIB2Q96AX9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIB2Q96AX9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIB2Q96AX9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIB2Q96AX9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIB2Q96AX9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIB2Q96AX9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIB2Q96AX9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIB2Q96AX9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIB2Q96AX9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIB2Q96AX9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MIB2Q96AX9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIB2Q96AX9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIB2Q96AX9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIB2Q96AX9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIB2Q96AX9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIB2Q96AX9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIB2Q96AX9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIB2Q96AX9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIB2Q96AX9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIB2Q96AX9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIB2Q96AX9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIB2Q96AX9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIB2Q96AX9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIB2Q96AX9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MIB2Q96AX9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MIB2Q96AX9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MIB2Q96AX9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MIB2Q96AX9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MIB2Q96AX9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MIB2Q96AX9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MIB2Q96AX9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MIB2Q96AX9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MIB2Q96AX9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MIB2Q96AX9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MIB2Q96AX9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MIB2Q96AX9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MIB2Q96AX9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MIB2Q96AX9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MIB2Q96AX9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MIB2Q96AX9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MIB2Q96AX9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MIB2Q96AX9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MIB2Q96AX9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MIB2Q96AX9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MIB2Q96AX9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MIB2Q96AX9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MIB2Q96AX9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MIB2Q96AX9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MIB2Q96AX9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MIB2Q96AX9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MIB2Q96AX9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MIB2Q96AX9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MIB2Q96AX9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MIB2Q96AX9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MIB2Q96AX9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MIB2Q96AX9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MIB2Q96AX9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MIB2Q96AX9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MIB2Q96AX9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MIB2Q96AX9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIB2Q96AX9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIB2Q96AX9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIB2Q96AX9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIB2Q96AX9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIB2Q96AX9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIB2Q96AX9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIB2Q96AX9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIB2Q96AX9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIB2Q96AX9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIB2Q96AX9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MIB2Q96AX9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIB2Q96AX9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIB2Q96AX9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIB2Q96AX9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIB2Q96AX9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms