Protein–RNA interactions for Protein: Q92928

RAB1C, Putative Ras-related protein Rab-1C, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1CQ92928 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB1CQ92928 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB1CQ92928 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB1CQ92928 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB1CQ92928 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB1CQ92928 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB1CQ92928 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB1CQ92928 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB1CQ92928 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB1CQ92928 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB1CQ92928 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB1CQ92928 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB1CQ92928 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB1CQ92928 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB1CQ92928 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB1CQ92928 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB1CQ92928 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB1CQ92928 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB1CQ92928 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB1CQ92928 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB1CQ92928 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB1CQ92928 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB1CQ92928 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB1CQ92928 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB1CQ92928 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB1CQ92928 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB1CQ92928 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB1CQ92928 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB1CQ92928 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB1CQ92928 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB1CQ92928 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB1CQ92928 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB1CQ92928 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB1CQ92928 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB1CQ92928 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB1CQ92928 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB1CQ92928 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB1CQ92928 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB1CQ92928 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB1CQ92928 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB1CQ92928 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB1CQ92928 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB1CQ92928 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB1CQ92928 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB1CQ92928 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB1CQ92928 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB1CQ92928 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB1CQ92928 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB1CQ92928 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB1CQ92928 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB1CQ92928 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB1CQ92928 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB1CQ92928 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB1CQ92928 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB1CQ92928 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB1CQ92928 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB1CQ92928 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB1CQ92928 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB1CQ92928 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB1CQ92928 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB1CQ92928 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB1CQ92928 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB1CQ92928 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB1CQ92928 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB1CQ92928 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB1CQ92928 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB1CQ92928 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB1CQ92928 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB1CQ92928 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB1CQ92928 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB1CQ92928 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RAB1CQ92928 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RAB1CQ92928 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB1CQ92928 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB1CQ92928 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB1CQ92928 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB1CQ92928 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB1CQ92928 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB1CQ92928 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB1CQ92928 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB1CQ92928 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB1CQ92928 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB1CQ92928 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAB1CQ92928 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB1CQ92928 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB1CQ92928 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB1CQ92928 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB1CQ92928 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB1CQ92928 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB1CQ92928 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB1CQ92928 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB1CQ92928 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB1CQ92928 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAB1CQ92928 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB1CQ92928 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB1CQ92928 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB1CQ92928 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB1CQ92928 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB1CQ92928 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB1CQ92928 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms