Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF148Q8N7C7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF148Q8N7C7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF148Q8N7C7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF148Q8N7C7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF148Q8N7C7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF148Q8N7C7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF148Q8N7C7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF148Q8N7C7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF148Q8N7C7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF148Q8N7C7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF148Q8N7C7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF148Q8N7C7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF148Q8N7C7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF148Q8N7C7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF148Q8N7C7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF148Q8N7C7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF148Q8N7C7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF148Q8N7C7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF148Q8N7C7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF148Q8N7C7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF148Q8N7C7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF148Q8N7C7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF148Q8N7C7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF148Q8N7C7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF148Q8N7C7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF148Q8N7C7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF148Q8N7C7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF148Q8N7C7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF148Q8N7C7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF148Q8N7C7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF148Q8N7C7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF148Q8N7C7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF148Q8N7C7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF148Q8N7C7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF148Q8N7C7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF148Q8N7C7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF148Q8N7C7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF148Q8N7C7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF148Q8N7C7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF148Q8N7C7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF148Q8N7C7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF148Q8N7C7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF148Q8N7C7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF148Q8N7C7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF148Q8N7C7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF148Q8N7C7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF148Q8N7C7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF148Q8N7C7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF148Q8N7C7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF148Q8N7C7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF148Q8N7C7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF148Q8N7C7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF148Q8N7C7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF148Q8N7C7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF148Q8N7C7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF148Q8N7C7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF148Q8N7C7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF148Q8N7C7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF148Q8N7C7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF148Q8N7C7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF148Q8N7C7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF148Q8N7C7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF148Q8N7C7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF148Q8N7C7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF148Q8N7C7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF148Q8N7C7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF148Q8N7C7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF148Q8N7C7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF148Q8N7C7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF148Q8N7C7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF148Q8N7C7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF148Q8N7C7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF148Q8N7C7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF148Q8N7C7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF148Q8N7C7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF148Q8N7C7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF148Q8N7C7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF148Q8N7C7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF148Q8N7C7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF148Q8N7C7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF148Q8N7C7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF148Q8N7C7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF148Q8N7C7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF148Q8N7C7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF148Q8N7C7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF148Q8N7C7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
RNF148Q8N7C7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF148Q8N7C7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF148Q8N7C7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF148Q8N7C7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF148Q8N7C7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF148Q8N7C7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF148Q8N7C7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF148Q8N7C7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF148Q8N7C7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF148Q8N7C7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF148Q8N7C7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF148Q8N7C7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF148Q8N7C7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
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