Protein–RNA interactions for Protein: Q86UV7

TRIM73, Tripartite motif-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM73Q86UV7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM73Q86UV7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM73Q86UV7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM73Q86UV7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM73Q86UV7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM73Q86UV7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM73Q86UV7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM73Q86UV7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM73Q86UV7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM73Q86UV7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM73Q86UV7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM73Q86UV7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM73Q86UV7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM73Q86UV7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM73Q86UV7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM73Q86UV7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM73Q86UV7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM73Q86UV7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM73Q86UV7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM73Q86UV7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM73Q86UV7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM73Q86UV7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM73Q86UV7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM73Q86UV7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM73Q86UV7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM73Q86UV7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM73Q86UV7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM73Q86UV7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM73Q86UV7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM73Q86UV7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM73Q86UV7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM73Q86UV7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM73Q86UV7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM73Q86UV7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM73Q86UV7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM73Q86UV7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM73Q86UV7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM73Q86UV7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM73Q86UV7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM73Q86UV7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM73Q86UV7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM73Q86UV7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM73Q86UV7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM73Q86UV7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM73Q86UV7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM73Q86UV7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM73Q86UV7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM73Q86UV7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM73Q86UV7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM73Q86UV7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM73Q86UV7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM73Q86UV7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM73Q86UV7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM73Q86UV7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM73Q86UV7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM73Q86UV7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM73Q86UV7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM73Q86UV7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM73Q86UV7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM73Q86UV7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM73Q86UV7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM73Q86UV7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM73Q86UV7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM73Q86UV7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM73Q86UV7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM73Q86UV7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM73Q86UV7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM73Q86UV7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM73Q86UV7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM73Q86UV7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM73Q86UV7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM73Q86UV7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM73Q86UV7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM73Q86UV7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM73Q86UV7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM73Q86UV7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM73Q86UV7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM73Q86UV7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM73Q86UV7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM73Q86UV7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM73Q86UV7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM73Q86UV7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM73Q86UV7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM73Q86UV7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM73Q86UV7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM73Q86UV7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM73Q86UV7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM73Q86UV7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM73Q86UV7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM73Q86UV7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM73Q86UV7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM73Q86UV7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM73Q86UV7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM73Q86UV7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM73Q86UV7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM73Q86UV7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM73Q86UV7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM73Q86UV7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM73Q86UV7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM73Q86UV7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms