Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT6

NLRX1, NLR family member X1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1Q86UT6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NLRX1Q86UT6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NLRX1Q86UT6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NLRX1Q86UT6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NLRX1Q86UT6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NLRX1Q86UT6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NLRX1Q86UT6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NLRX1Q86UT6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRX1Q86UT6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRX1Q86UT6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRX1Q86UT6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NLRX1Q86UT6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NLRX1Q86UT6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NLRX1Q86UT6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NLRX1Q86UT6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NLRX1Q86UT6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NLRX1Q86UT6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NLRX1Q86UT6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NLRX1Q86UT6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NLRX1Q86UT6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NLRX1Q86UT6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRX1Q86UT6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRX1Q86UT6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRX1Q86UT6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRX1Q86UT6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRX1Q86UT6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRX1Q86UT6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRX1Q86UT6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRX1Q86UT6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRX1Q86UT6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRX1Q86UT6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRX1Q86UT6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRX1Q86UT6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRX1Q86UT6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRX1Q86UT6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRX1Q86UT6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRX1Q86UT6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NLRX1Q86UT6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRX1Q86UT6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRX1Q86UT6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRX1Q86UT6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRX1Q86UT6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRX1Q86UT6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRX1Q86UT6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRX1Q86UT6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRX1Q86UT6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRX1Q86UT6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRX1Q86UT6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRX1Q86UT6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRX1Q86UT6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRX1Q86UT6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRX1Q86UT6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRX1Q86UT6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRX1Q86UT6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NLRX1Q86UT6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRX1Q86UT6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRX1Q86UT6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRX1Q86UT6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRX1Q86UT6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRX1Q86UT6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRX1Q86UT6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRX1Q86UT6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRX1Q86UT6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRX1Q86UT6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRX1Q86UT6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRX1Q86UT6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRX1Q86UT6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRX1Q86UT6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRX1Q86UT6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRX1Q86UT6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRX1Q86UT6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRX1Q86UT6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRX1Q86UT6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRX1Q86UT6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRX1Q86UT6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRX1Q86UT6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRX1Q86UT6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NLRX1Q86UT6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
NLRX1Q86UT6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NLRX1Q86UT6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NLRX1Q86UT6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NLRX1Q86UT6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NLRX1Q86UT6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NLRX1Q86UT6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRX1Q86UT6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRX1Q86UT6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRX1Q86UT6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRX1Q86UT6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRX1Q86UT6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NLRX1Q86UT6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NLRX1Q86UT6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRX1Q86UT6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRX1Q86UT6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRX1Q86UT6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRX1Q86UT6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRX1Q86UT6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRX1Q86UT6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRX1Q86UT6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRX1Q86UT6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRX1Q86UT6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms