Protein–RNA interactions for Protein: Q86UC2

RSPH3, Radial spoke head protein 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH3Q86UC2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RSPH3Q86UC2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RSPH3Q86UC2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RSPH3Q86UC2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RSPH3Q86UC2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RSPH3Q86UC2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RSPH3Q86UC2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RSPH3Q86UC2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RSPH3Q86UC2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RSPH3Q86UC2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RSPH3Q86UC2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RSPH3Q86UC2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RSPH3Q86UC2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RSPH3Q86UC2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RSPH3Q86UC2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RSPH3Q86UC2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RSPH3Q86UC2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RSPH3Q86UC2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RSPH3Q86UC2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RSPH3Q86UC2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RSPH3Q86UC2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH3Q86UC2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH3Q86UC2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH3Q86UC2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RSPH3Q86UC2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RSPH3Q86UC2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH3Q86UC2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH3Q86UC2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH3Q86UC2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH3Q86UC2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH3Q86UC2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH3Q86UC2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH3Q86UC2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH3Q86UC2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RSPH3Q86UC2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH3Q86UC2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH3Q86UC2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH3Q86UC2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH3Q86UC2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH3Q86UC2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH3Q86UC2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH3Q86UC2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RSPH3Q86UC2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RSPH3Q86UC2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RSPH3Q86UC2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH3Q86UC2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH3Q86UC2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH3Q86UC2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH3Q86UC2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RSPH3Q86UC2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RSPH3Q86UC2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RSPH3Q86UC2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RSPH3Q86UC2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RSPH3Q86UC2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RSPH3Q86UC2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RSPH3Q86UC2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RSPH3Q86UC2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RSPH3Q86UC2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RSPH3Q86UC2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RSPH3Q86UC2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH3Q86UC2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH3Q86UC2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPH3Q86UC2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RSPH3Q86UC2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RSPH3Q86UC2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RSPH3Q86UC2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH3Q86UC2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH3Q86UC2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH3Q86UC2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH3Q86UC2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH3Q86UC2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH3Q86UC2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RSPH3Q86UC2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPH3Q86UC2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPH3Q86UC2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPH3Q86UC2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH3Q86UC2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH3Q86UC2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH3Q86UC2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH3Q86UC2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH3Q86UC2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH3Q86UC2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH3Q86UC2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RSPH3Q86UC2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RSPH3Q86UC2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RSPH3Q86UC2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RSPH3Q86UC2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RSPH3Q86UC2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RSPH3Q86UC2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RSPH3Q86UC2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RSPH3Q86UC2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RSPH3Q86UC2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RSPH3Q86UC2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RSPH3Q86UC2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RSPH3Q86UC2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RSPH3Q86UC2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RSPH3Q86UC2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RSPH3Q86UC2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RSPH3Q86UC2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RSPH3Q86UC2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms