Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
FGD6Q6ZV73 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.85
FGD6Q6ZV73 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
FGD6Q6ZV73 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
FGD6Q6ZV73 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
FGD6Q6ZV73 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
FGD6Q6ZV73 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
FGD6Q6ZV73 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
FGD6Q6ZV73 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
FGD6Q6ZV73 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
FGD6Q6ZV73 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
FGD6Q6ZV73 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
FGD6Q6ZV73 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
FGD6Q6ZV73 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
FGD6Q6ZV73 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
FGD6Q6ZV73 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC39.04■■■■□ 3.84
FGD6Q6ZV73 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
FGD6Q6ZV73 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
FGD6Q6ZV73 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
FGD6Q6ZV73 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
FGD6Q6ZV73 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
FGD6Q6ZV73 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
FGD6Q6ZV73 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC39.01■■■■□ 3.84
FGD6Q6ZV73 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC39.01■■■■□ 3.83
FGD6Q6ZV73 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
FGD6Q6ZV73 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
FGD6Q6ZV73 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
FGD6Q6ZV73 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
FGD6Q6ZV73 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
FGD6Q6ZV73 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
FGD6Q6ZV73 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
FGD6Q6ZV73 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
FGD6Q6ZV73 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
FGD6Q6ZV73 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
FGD6Q6ZV73 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
FGD6Q6ZV73 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
FGD6Q6ZV73 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
FGD6Q6ZV73 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
FGD6Q6ZV73 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
FGD6Q6ZV73 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
FGD6Q6ZV73 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
FGD6Q6ZV73 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
FGD6Q6ZV73 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
FGD6Q6ZV73 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
FGD6Q6ZV73 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
FGD6Q6ZV73 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
FGD6Q6ZV73 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
FGD6Q6ZV73 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
FGD6Q6ZV73 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
FGD6Q6ZV73 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
FGD6Q6ZV73 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.9■■■■□ 3.82
FGD6Q6ZV73 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
FGD6Q6ZV73 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
FGD6Q6ZV73 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
FGD6Q6ZV73 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
FGD6Q6ZV73 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
FGD6Q6ZV73 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
FGD6Q6ZV73 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
FGD6Q6ZV73 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
FGD6Q6ZV73 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
FGD6Q6ZV73 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
FGD6Q6ZV73 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
FGD6Q6ZV73 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
FGD6Q6ZV73 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
FGD6Q6ZV73 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
FGD6Q6ZV73 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
FGD6Q6ZV73 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
FGD6Q6ZV73 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC38.83■■■■□ 3.81
FGD6Q6ZV73 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
FGD6Q6ZV73 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
FGD6Q6ZV73 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
FGD6Q6ZV73 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
FGD6Q6ZV73 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
FGD6Q6ZV73 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
FGD6Q6ZV73 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
FGD6Q6ZV73 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
FGD6Q6ZV73 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
FGD6Q6ZV73 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
FGD6Q6ZV73 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
FGD6Q6ZV73 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
FGD6Q6ZV73 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
FGD6Q6ZV73 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.79
FGD6Q6ZV73 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
FGD6Q6ZV73 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
FGD6Q6ZV73 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
FGD6Q6ZV73 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
FGD6Q6ZV73 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
FGD6Q6ZV73 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
FGD6Q6ZV73 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC38.73■■■■□ 3.79
FGD6Q6ZV73 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
FGD6Q6ZV73 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
FGD6Q6ZV73 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
FGD6Q6ZV73 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
FGD6Q6ZV73 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
FGD6Q6ZV73 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
FGD6Q6ZV73 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
FGD6Q6ZV73 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
FGD6Q6ZV73 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
FGD6Q6ZV73 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC38.71■■■■□ 3.79
FGD6Q6ZV73 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms