Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC52.9■■■■■ 6.06
FGD6Q6ZV73 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC51.53■■■■■ 5.84
FGD6Q6ZV73 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.5■■■■■ 5.83
FGD6Q6ZV73 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.41■■■■■ 5.82
FGD6Q6ZV73 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.21■■■■■ 5.79
FGD6Q6ZV73 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.19■■■■■ 5.78
FGD6Q6ZV73 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC51.03■■■■■ 5.76
FGD6Q6ZV73 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC50.62■■■■■ 5.69
FGD6Q6ZV73 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC49.87■■■■■ 5.57
FGD6Q6ZV73 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC49.76■■■■■ 5.56
FGD6Q6ZV73 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC49.46■■■■■ 5.51
FGD6Q6ZV73 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC49.43■■■■■ 5.5
FGD6Q6ZV73 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.41■■■■■ 5.5
FGD6Q6ZV73 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.37■■■■■ 5.49
FGD6Q6ZV73 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC49.29■■■■■ 5.48
FGD6Q6ZV73 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC49.1■■■■■ 5.45
FGD6Q6ZV73 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC49.02■■■■■ 5.44
FGD6Q6ZV73 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.96■■■■■ 5.43
FGD6Q6ZV73 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.95■■■■■ 5.43
FGD6Q6ZV73 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.57■■■■■ 5.37
FGD6Q6ZV73 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.35■■■■■ 5.33
FGD6Q6ZV73 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC48.33■■■■■ 5.33
FGD6Q6ZV73 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC48.29■■■■■ 5.32
FGD6Q6ZV73 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.2■■■■■ 5.31
FGD6Q6ZV73 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
FGD6Q6ZV73 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
FGD6Q6ZV73 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.74■■■■■ 5.23
FGD6Q6ZV73 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
FGD6Q6ZV73 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.67■■■■■ 5.22
FGD6Q6ZV73 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC47.57■■■■■ 5.21
FGD6Q6ZV73 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
FGD6Q6ZV73 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
FGD6Q6ZV73 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC47.44■■■■■ 5.18
FGD6Q6ZV73 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
FGD6Q6ZV73 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC47.22■■■■■ 5.15
FGD6Q6ZV73 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.15■■■■■ 5.14
FGD6Q6ZV73 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
FGD6Q6ZV73 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.85■■■■■ 5.09
FGD6Q6ZV73 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC46.83■■■■■ 5.09
FGD6Q6ZV73 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
FGD6Q6ZV73 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC46.74■■■■■ 5.07
FGD6Q6ZV73 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.61■■■■■ 5.05
FGD6Q6ZV73 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC46.61■■■■■ 5.05
FGD6Q6ZV73 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.59■■■■■ 5.05
FGD6Q6ZV73 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC46.54■■■■■ 5.04
FGD6Q6ZV73 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC46.54■■■■■ 5.04
FGD6Q6ZV73 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
FGD6Q6ZV73 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
FGD6Q6ZV73 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC46.43■■■■■ 5.02
FGD6Q6ZV73 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.37■■■■■ 5.01
FGD6Q6ZV73 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.29■■■■■ 5
FGD6Q6ZV73 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC46.21■■■■■ 4.99
FGD6Q6ZV73 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC46.21■■■■■ 4.99
FGD6Q6ZV73 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.13■■■■■ 4.97
FGD6Q6ZV73 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
FGD6Q6ZV73 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
FGD6Q6ZV73 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.98■■■■■ 4.95
FGD6Q6ZV73 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
FGD6Q6ZV73 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
FGD6Q6ZV73 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC45.81■■■■■ 4.92
FGD6Q6ZV73 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
FGD6Q6ZV73 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
FGD6Q6ZV73 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
FGD6Q6ZV73 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC45.5■■■■■ 4.87
FGD6Q6ZV73 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
FGD6Q6ZV73 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC45.45■■■■■ 4.87
FGD6Q6ZV73 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC45.44■■■■■ 4.86
FGD6Q6ZV73 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.86
FGD6Q6ZV73 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC45.41■■■■■ 4.86
FGD6Q6ZV73 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
FGD6Q6ZV73 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC45.36■■■■■ 4.85
FGD6Q6ZV73 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
FGD6Q6ZV73 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
FGD6Q6ZV73 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
FGD6Q6ZV73 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC45.18■■■■■ 4.82
FGD6Q6ZV73 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
FGD6Q6ZV73 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC45.12■■■■■ 4.81
FGD6Q6ZV73 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
FGD6Q6ZV73 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC45.06■■■■■ 4.8
FGD6Q6ZV73 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
FGD6Q6ZV73 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC45.03■■■■■ 4.8
FGD6Q6ZV73 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
FGD6Q6ZV73 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.97■■■■■ 4.79
FGD6Q6ZV73 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC44.97■■■■■ 4.79
FGD6Q6ZV73 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
FGD6Q6ZV73 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
FGD6Q6ZV73 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
FGD6Q6ZV73 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.89■■■■■ 4.78
FGD6Q6ZV73 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.76
FGD6Q6ZV73 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
FGD6Q6ZV73 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC44.78■■■■■ 4.76
FGD6Q6ZV73 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
FGD6Q6ZV73 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC44.77■■■■■ 4.76
FGD6Q6ZV73 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC44.76■■■■■ 4.76
FGD6Q6ZV73 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC44.75■■■■■ 4.76
FGD6Q6ZV73 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.76
FGD6Q6ZV73 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.69■■■■■ 4.74
FGD6Q6ZV73 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.68■■■■■ 4.74
FGD6Q6ZV73 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
FGD6Q6ZV73 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC44.65■■■■■ 4.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms