Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
LRRC9Q6ZRR7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
LRRC9Q6ZRR7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC39.69■■■■□ 3.94
LRRC9Q6ZRR7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
LRRC9Q6ZRR7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.68■■■■□ 3.94
LRRC9Q6ZRR7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
LRRC9Q6ZRR7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
LRRC9Q6ZRR7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
LRRC9Q6ZRR7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
LRRC9Q6ZRR7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
LRRC9Q6ZRR7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
LRRC9Q6ZRR7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
LRRC9Q6ZRR7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
LRRC9Q6ZRR7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
LRRC9Q6ZRR7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
LRRC9Q6ZRR7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
LRRC9Q6ZRR7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
LRRC9Q6ZRR7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
LRRC9Q6ZRR7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC39.65■■■■□ 3.94
LRRC9Q6ZRR7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
LRRC9Q6ZRR7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
LRRC9Q6ZRR7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
LRRC9Q6ZRR7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
LRRC9Q6ZRR7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
LRRC9Q6ZRR7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC39.63■■■■□ 3.94
LRRC9Q6ZRR7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
LRRC9Q6ZRR7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC39.62■■■■□ 3.93
LRRC9Q6ZRR7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
LRRC9Q6ZRR7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
LRRC9Q6ZRR7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
LRRC9Q6ZRR7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
LRRC9Q6ZRR7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
LRRC9Q6ZRR7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
LRRC9Q6ZRR7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
LRRC9Q6ZRR7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
LRRC9Q6ZRR7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
LRRC9Q6ZRR7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
LRRC9Q6ZRR7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
LRRC9Q6ZRR7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC39.57■■■■□ 3.93
LRRC9Q6ZRR7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
LRRC9Q6ZRR7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
LRRC9Q6ZRR7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
LRRC9Q6ZRR7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
LRRC9Q6ZRR7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
LRRC9Q6ZRR7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
LRRC9Q6ZRR7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
LRRC9Q6ZRR7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
LRRC9Q6ZRR7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
LRRC9Q6ZRR7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
LRRC9Q6ZRR7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
LRRC9Q6ZRR7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
LRRC9Q6ZRR7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC39.52■■■■□ 3.92
LRRC9Q6ZRR7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
LRRC9Q6ZRR7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
LRRC9Q6ZRR7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.5■■■■□ 3.91
LRRC9Q6ZRR7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
LRRC9Q6ZRR7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
LRRC9Q6ZRR7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
LRRC9Q6ZRR7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
LRRC9Q6ZRR7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
LRRC9Q6ZRR7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
LRRC9Q6ZRR7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
LRRC9Q6ZRR7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
LRRC9Q6ZRR7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
LRRC9Q6ZRR7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
LRRC9Q6ZRR7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
LRRC9Q6ZRR7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC39.46■■■■□ 3.91
LRRC9Q6ZRR7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC39.44■■■■□ 3.9
LRRC9Q6ZRR7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
LRRC9Q6ZRR7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC39.44■■■■□ 3.9
LRRC9Q6ZRR7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC39.44■■■■□ 3.9
LRRC9Q6ZRR7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
LRRC9Q6ZRR7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
LRRC9Q6ZRR7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
LRRC9Q6ZRR7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
LRRC9Q6ZRR7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
LRRC9Q6ZRR7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
LRRC9Q6ZRR7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
LRRC9Q6ZRR7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.9
LRRC9Q6ZRR7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
LRRC9Q6ZRR7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
LRRC9Q6ZRR7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
LRRC9Q6ZRR7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
LRRC9Q6ZRR7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
LRRC9Q6ZRR7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
LRRC9Q6ZRR7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
LRRC9Q6ZRR7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
LRRC9Q6ZRR7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
LRRC9Q6ZRR7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC39.35■■■■□ 3.89
LRRC9Q6ZRR7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
LRRC9Q6ZRR7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
LRRC9Q6ZRR7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
LRRC9Q6ZRR7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
LRRC9Q6ZRR7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
LRRC9Q6ZRR7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
LRRC9Q6ZRR7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
LRRC9Q6ZRR7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
LRRC9Q6ZRR7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
LRRC9Q6ZRR7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms