Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXF1

TMEM108, Transmembrane protein 108, humanhuman

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Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM108Q6UXF1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM108Q6UXF1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM108Q6UXF1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM108Q6UXF1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM108Q6UXF1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM108Q6UXF1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM108Q6UXF1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM108Q6UXF1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM108Q6UXF1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM108Q6UXF1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM108Q6UXF1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM108Q6UXF1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM108Q6UXF1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM108Q6UXF1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM108Q6UXF1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM108Q6UXF1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM108Q6UXF1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM108Q6UXF1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM108Q6UXF1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM108Q6UXF1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM108Q6UXF1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM108Q6UXF1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM108Q6UXF1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM108Q6UXF1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM108Q6UXF1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM108Q6UXF1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM108Q6UXF1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM108Q6UXF1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM108Q6UXF1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMEM108Q6UXF1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM108Q6UXF1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM108Q6UXF1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM108Q6UXF1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM108Q6UXF1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM108Q6UXF1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM108Q6UXF1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM108Q6UXF1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM108Q6UXF1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM108Q6UXF1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM108Q6UXF1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM108Q6UXF1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM108Q6UXF1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM108Q6UXF1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM108Q6UXF1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM108Q6UXF1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM108Q6UXF1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM108Q6UXF1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM108Q6UXF1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM108Q6UXF1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM108Q6UXF1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM108Q6UXF1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM108Q6UXF1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM108Q6UXF1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM108Q6UXF1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM108Q6UXF1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM108Q6UXF1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM108Q6UXF1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM108Q6UXF1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM108Q6UXF1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM108Q6UXF1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM108Q6UXF1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM108Q6UXF1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM108Q6UXF1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM108Q6UXF1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM108Q6UXF1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM108Q6UXF1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM108Q6UXF1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM108Q6UXF1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM108Q6UXF1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM108Q6UXF1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM108Q6UXF1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM108Q6UXF1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM108Q6UXF1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM108Q6UXF1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM108Q6UXF1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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TMEM108Q6UXF1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM108Q6UXF1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM108Q6UXF1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM108Q6UXF1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM108Q6UXF1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM108Q6UXF1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM108Q6UXF1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM108Q6UXF1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM108Q6UXF1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM108Q6UXF1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM108Q6UXF1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM108Q6UXF1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM108Q6UXF1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM108Q6UXF1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM108Q6UXF1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM108Q6UXF1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM108Q6UXF1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM108Q6UXF1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM108Q6UXF1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM108Q6UXF1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM108Q6UXF1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM108Q6UXF1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM108Q6UXF1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM108Q6UXF1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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