Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1R3

MSANTD2, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD2Q6P1R3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MSANTD2Q6P1R3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MSANTD2Q6P1R3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MSANTD2Q6P1R3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MSANTD2Q6P1R3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MSANTD2Q6P1R3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MSANTD2Q6P1R3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MSANTD2Q6P1R3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MSANTD2Q6P1R3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MSANTD2Q6P1R3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MSANTD2Q6P1R3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSANTD2Q6P1R3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSANTD2Q6P1R3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSANTD2Q6P1R3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSANTD2Q6P1R3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSANTD2Q6P1R3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSANTD2Q6P1R3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSANTD2Q6P1R3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSANTD2Q6P1R3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSANTD2Q6P1R3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSANTD2Q6P1R3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSANTD2Q6P1R3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSANTD2Q6P1R3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSANTD2Q6P1R3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MSANTD2Q6P1R3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MSANTD2Q6P1R3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MSANTD2Q6P1R3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MSANTD2Q6P1R3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms