Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCM7

SLC25A25, Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A25Q6KCM7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC25A25Q6KCM7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC25A25Q6KCM7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC25A25Q6KCM7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC25A25Q6KCM7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC25A25Q6KCM7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC25A25Q6KCM7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC25A25Q6KCM7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC25A25Q6KCM7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC25A25Q6KCM7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A25Q6KCM7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A25Q6KCM7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A25Q6KCM7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A25Q6KCM7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A25Q6KCM7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A25Q6KCM7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A25Q6KCM7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A25Q6KCM7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A25Q6KCM7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A25Q6KCM7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A25Q6KCM7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A25Q6KCM7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A25Q6KCM7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A25Q6KCM7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC25A25Q6KCM7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC25A25Q6KCM7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC25A25Q6KCM7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC25A25Q6KCM7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC25A25Q6KCM7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC25A25Q6KCM7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC25A25Q6KCM7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A25Q6KCM7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC25A25Q6KCM7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC25A25Q6KCM7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A25Q6KCM7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A25Q6KCM7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A25Q6KCM7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A25Q6KCM7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A25Q6KCM7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A25Q6KCM7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A25Q6KCM7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A25Q6KCM7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A25Q6KCM7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A25Q6KCM7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A25Q6KCM7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A25Q6KCM7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A25Q6KCM7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A25Q6KCM7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A25Q6KCM7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A25Q6KCM7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A25Q6KCM7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A25Q6KCM7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A25Q6KCM7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A25Q6KCM7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A25Q6KCM7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A25Q6KCM7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A25Q6KCM7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A25Q6KCM7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A25Q6KCM7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A25Q6KCM7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A25Q6KCM7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms