Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE9

LCN8, Epididymal-specific lipocalin-8, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN8Q6JVE9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCN8Q6JVE9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCN8Q6JVE9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCN8Q6JVE9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCN8Q6JVE9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCN8Q6JVE9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCN8Q6JVE9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCN8Q6JVE9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCN8Q6JVE9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCN8Q6JVE9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCN8Q6JVE9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCN8Q6JVE9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCN8Q6JVE9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCN8Q6JVE9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCN8Q6JVE9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCN8Q6JVE9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCN8Q6JVE9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCN8Q6JVE9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCN8Q6JVE9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCN8Q6JVE9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LCN8Q6JVE9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LCN8Q6JVE9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LCN8Q6JVE9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LCN8Q6JVE9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LCN8Q6JVE9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCN8Q6JVE9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCN8Q6JVE9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCN8Q6JVE9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCN8Q6JVE9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCN8Q6JVE9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCN8Q6JVE9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCN8Q6JVE9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCN8Q6JVE9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LCN8Q6JVE9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCN8Q6JVE9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCN8Q6JVE9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCN8Q6JVE9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCN8Q6JVE9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCN8Q6JVE9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCN8Q6JVE9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCN8Q6JVE9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCN8Q6JVE9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCN8Q6JVE9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LCN8Q6JVE9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LCN8Q6JVE9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LCN8Q6JVE9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LCN8Q6JVE9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LCN8Q6JVE9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCN8Q6JVE9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LCN8Q6JVE9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCN8Q6JVE9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCN8Q6JVE9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCN8Q6JVE9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCN8Q6JVE9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCN8Q6JVE9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCN8Q6JVE9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCN8Q6JVE9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCN8Q6JVE9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCN8Q6JVE9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCN8Q6JVE9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LCN8Q6JVE9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCN8Q6JVE9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCN8Q6JVE9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCN8Q6JVE9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCN8Q6JVE9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCN8Q6JVE9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCN8Q6JVE9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCN8Q6JVE9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCN8Q6JVE9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCN8Q6JVE9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCN8Q6JVE9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCN8Q6JVE9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCN8Q6JVE9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCN8Q6JVE9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCN8Q6JVE9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCN8Q6JVE9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCN8Q6JVE9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCN8Q6JVE9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCN8Q6JVE9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCN8Q6JVE9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCN8Q6JVE9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LCN8Q6JVE9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCN8Q6JVE9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCN8Q6JVE9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCN8Q6JVE9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCN8Q6JVE9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCN8Q6JVE9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCN8Q6JVE9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCN8Q6JVE9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCN8Q6JVE9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCN8Q6JVE9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCN8Q6JVE9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCN8Q6JVE9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCN8Q6JVE9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCN8Q6JVE9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCN8Q6JVE9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCN8Q6JVE9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCN8Q6JVE9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCN8Q6JVE9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCN8Q6JVE9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
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