Protein–RNA interactions for Protein: Q5Y7H0

HLA-DQA1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQA1Q5Y7H0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HLA-DQA1Q5Y7H0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-DQA1Q5Y7H0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-DQA1Q5Y7H0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-DQA1Q5Y7H0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-DQA1Q5Y7H0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HLA-DQA1Q5Y7H0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HLA-DQA1Q5Y7H0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HLA-DQA1Q5Y7H0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HLA-DQA1Q5Y7H0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-DQA1Q5Y7H0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-DQA1Q5Y7H0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-DQA1Q5Y7H0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-DQA1Q5Y7H0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-DQA1Q5Y7H0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-DQA1Q5Y7H0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-DQA1Q5Y7H0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-DQA1Q5Y7H0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HLA-DQA1Q5Y7H0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DQA1Q5Y7H0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DQA1Q5Y7H0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DQA1Q5Y7H0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DQA1Q5Y7H0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DQA1Q5Y7H0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DQA1Q5Y7H0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DQA1Q5Y7H0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DQA1Q5Y7H0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DQA1Q5Y7H0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DQA1Q5Y7H0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DQA1Q5Y7H0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DQA1Q5Y7H0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DQA1Q5Y7H0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-DQA1Q5Y7H0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DQA1Q5Y7H0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DQA1Q5Y7H0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DQA1Q5Y7H0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DQA1Q5Y7H0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-DQA1Q5Y7H0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-DQA1Q5Y7H0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-DQA1Q5Y7H0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HLA-DQA1Q5Y7H0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DQA1Q5Y7H0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DQA1Q5Y7H0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DQA1Q5Y7H0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-DQA1Q5Y7H0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-DQA1Q5Y7H0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-DQA1Q5Y7H0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-DQA1Q5Y7H0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-DQA1Q5Y7H0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-DQA1Q5Y7H0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-DQA1Q5Y7H0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-DQA1Q5Y7H0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-DQA1Q5Y7H0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-DQA1Q5Y7H0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-DQA1Q5Y7H0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-DQA1Q5Y7H0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-DQA1Q5Y7H0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-DQA1Q5Y7H0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-DQA1Q5Y7H0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-DQA1Q5Y7H0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-DQA1Q5Y7H0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-DQA1Q5Y7H0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-DQA1Q5Y7H0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DQA1Q5Y7H0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DQA1Q5Y7H0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DQA1Q5Y7H0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DQA1Q5Y7H0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-DQA1Q5Y7H0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-DQA1Q5Y7H0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-DQA1Q5Y7H0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-DQA1Q5Y7H0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DQA1Q5Y7H0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DQA1Q5Y7H0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DQA1Q5Y7H0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DQA1Q5Y7H0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DQA1Q5Y7H0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-DQA1Q5Y7H0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-DQA1Q5Y7H0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-DQA1Q5Y7H0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-DQA1Q5Y7H0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-DQA1Q5Y7H0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DQA1Q5Y7H0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DQA1Q5Y7H0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DQA1Q5Y7H0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DQA1Q5Y7H0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DQA1Q5Y7H0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DQA1Q5Y7H0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DQA1Q5Y7H0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-DQA1Q5Y7H0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-DQA1Q5Y7H0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HLA-DQA1Q5Y7H0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HLA-DQA1Q5Y7H0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-DQA1Q5Y7H0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-DQA1Q5Y7H0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-DQA1Q5Y7H0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms