Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVM6

CCDC30, Coiled-coil domain-containing protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC30Q5VVM6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC30Q5VVM6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC30Q5VVM6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC30Q5VVM6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC30Q5VVM6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC30Q5VVM6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC30Q5VVM6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC30Q5VVM6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC30Q5VVM6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC30Q5VVM6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC30Q5VVM6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC30Q5VVM6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC30Q5VVM6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC30Q5VVM6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC30Q5VVM6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC30Q5VVM6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC30Q5VVM6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC30Q5VVM6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC30Q5VVM6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC30Q5VVM6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC30Q5VVM6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC30Q5VVM6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC30Q5VVM6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC30Q5VVM6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC30Q5VVM6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC30Q5VVM6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC30Q5VVM6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC30Q5VVM6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC30Q5VVM6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC30Q5VVM6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC30Q5VVM6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC30Q5VVM6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC30Q5VVM6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC30Q5VVM6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC30Q5VVM6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC30Q5VVM6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC30Q5VVM6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC30Q5VVM6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC30Q5VVM6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC30Q5VVM6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC30Q5VVM6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC30Q5VVM6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC30Q5VVM6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC30Q5VVM6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC30Q5VVM6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC30Q5VVM6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC30Q5VVM6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC30Q5VVM6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC30Q5VVM6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC30Q5VVM6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC30Q5VVM6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC30Q5VVM6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC30Q5VVM6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC30Q5VVM6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC30Q5VVM6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC30Q5VVM6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC30Q5VVM6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC30Q5VVM6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC30Q5VVM6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CCDC30Q5VVM6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC30Q5VVM6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC30Q5VVM6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC30Q5VVM6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC30Q5VVM6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC30Q5VVM6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC30Q5VVM6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC30Q5VVM6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC30Q5VVM6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC30Q5VVM6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC30Q5VVM6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC30Q5VVM6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC30Q5VVM6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC30Q5VVM6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC30Q5VVM6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC30Q5VVM6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC30Q5VVM6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC30Q5VVM6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC30Q5VVM6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC30Q5VVM6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CCDC30Q5VVM6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC30Q5VVM6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC30Q5VVM6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC30Q5VVM6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC30Q5VVM6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC30Q5VVM6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC30Q5VVM6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC30Q5VVM6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC30Q5VVM6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC30Q5VVM6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC30Q5VVM6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC30Q5VVM6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC30Q5VVM6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC30Q5VVM6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC30Q5VVM6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC30Q5VVM6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC30Q5VVM6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC30Q5VVM6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC30Q5VVM6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC30Q5VVM6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC30Q5VVM6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.5 ms