Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GFI1BQ5VTD9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GFI1BQ5VTD9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GFI1BQ5VTD9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GFI1BQ5VTD9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GFI1BQ5VTD9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GFI1BQ5VTD9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GFI1BQ5VTD9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GFI1BQ5VTD9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GFI1BQ5VTD9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GFI1BQ5VTD9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GFI1BQ5VTD9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GFI1BQ5VTD9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GFI1BQ5VTD9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GFI1BQ5VTD9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GFI1BQ5VTD9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GFI1BQ5VTD9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GFI1BQ5VTD9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GFI1BQ5VTD9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GFI1BQ5VTD9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GFI1BQ5VTD9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GFI1BQ5VTD9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GFI1BQ5VTD9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GFI1BQ5VTD9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GFI1BQ5VTD9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GFI1BQ5VTD9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GFI1BQ5VTD9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GFI1BQ5VTD9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GFI1BQ5VTD9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GFI1BQ5VTD9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GFI1BQ5VTD9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GFI1BQ5VTD9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GFI1BQ5VTD9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GFI1BQ5VTD9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GFI1BQ5VTD9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GFI1BQ5VTD9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GFI1BQ5VTD9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GFI1BQ5VTD9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GFI1BQ5VTD9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GFI1BQ5VTD9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GFI1BQ5VTD9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GFI1BQ5VTD9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GFI1BQ5VTD9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GFI1BQ5VTD9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GFI1BQ5VTD9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GFI1BQ5VTD9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GFI1BQ5VTD9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GFI1BQ5VTD9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GFI1BQ5VTD9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GFI1BQ5VTD9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GFI1BQ5VTD9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GFI1BQ5VTD9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GFI1BQ5VTD9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GFI1BQ5VTD9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GFI1BQ5VTD9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GFI1BQ5VTD9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GFI1BQ5VTD9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GFI1BQ5VTD9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GFI1BQ5VTD9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GFI1BQ5VTD9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms