Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC04

ATP1A1-AS1, Putative uncharacterized protein ATP1A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A1-AS1Q5TC04 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP1A1-AS1Q5TC04 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP1A1-AS1Q5TC04 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP1A1-AS1Q5TC04 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP1A1-AS1Q5TC04 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP1A1-AS1Q5TC04 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP1A1-AS1Q5TC04 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP1A1-AS1Q5TC04 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP1A1-AS1Q5TC04 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP1A1-AS1Q5TC04 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP1A1-AS1Q5TC04 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP1A1-AS1Q5TC04 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP1A1-AS1Q5TC04 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP1A1-AS1Q5TC04 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP1A1-AS1Q5TC04 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP1A1-AS1Q5TC04 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP1A1-AS1Q5TC04 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP1A1-AS1Q5TC04 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP1A1-AS1Q5TC04 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP1A1-AS1Q5TC04 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP1A1-AS1Q5TC04 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP1A1-AS1Q5TC04 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP1A1-AS1Q5TC04 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP1A1-AS1Q5TC04 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP1A1-AS1Q5TC04 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP1A1-AS1Q5TC04 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP1A1-AS1Q5TC04 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP1A1-AS1Q5TC04 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP1A1-AS1Q5TC04 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP1A1-AS1Q5TC04 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP1A1-AS1Q5TC04 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP1A1-AS1Q5TC04 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP1A1-AS1Q5TC04 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP1A1-AS1Q5TC04 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP1A1-AS1Q5TC04 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP1A1-AS1Q5TC04 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP1A1-AS1Q5TC04 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP1A1-AS1Q5TC04 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP1A1-AS1Q5TC04 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP1A1-AS1Q5TC04 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP1A1-AS1Q5TC04 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP1A1-AS1Q5TC04 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP1A1-AS1Q5TC04 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP1A1-AS1Q5TC04 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP1A1-AS1Q5TC04 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP1A1-AS1Q5TC04 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP1A1-AS1Q5TC04 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP1A1-AS1Q5TC04 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP1A1-AS1Q5TC04 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1A1-AS1Q5TC04 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1A1-AS1Q5TC04 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1A1-AS1Q5TC04 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1A1-AS1Q5TC04 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1A1-AS1Q5TC04 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1A1-AS1Q5TC04 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1A1-AS1Q5TC04 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1A1-AS1Q5TC04 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP1A1-AS1Q5TC04 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP1A1-AS1Q5TC04 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP1A1-AS1Q5TC04 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP1A1-AS1Q5TC04 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP1A1-AS1Q5TC04 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP1A1-AS1Q5TC04 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP1A1-AS1Q5TC04 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP1A1-AS1Q5TC04 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP1A1-AS1Q5TC04 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP1A1-AS1Q5TC04 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP1A1-AS1Q5TC04 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP1A1-AS1Q5TC04 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP1A1-AS1Q5TC04 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP1A1-AS1Q5TC04 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP1A1-AS1Q5TC04 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP1A1-AS1Q5TC04 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP1A1-AS1Q5TC04 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP1A1-AS1Q5TC04 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP1A1-AS1Q5TC04 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP1A1-AS1Q5TC04 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP1A1-AS1Q5TC04 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP1A1-AS1Q5TC04 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP1A1-AS1Q5TC04 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP1A1-AS1Q5TC04 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP1A1-AS1Q5TC04 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP1A1-AS1Q5TC04 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP1A1-AS1Q5TC04 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP1A1-AS1Q5TC04 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP1A1-AS1Q5TC04 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP1A1-AS1Q5TC04 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP1A1-AS1Q5TC04 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP1A1-AS1Q5TC04 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP1A1-AS1Q5TC04 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP1A1-AS1Q5TC04 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP1A1-AS1Q5TC04 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP1A1-AS1Q5TC04 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP1A1-AS1Q5TC04 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP1A1-AS1Q5TC04 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms